PRJNA902288：光动力疗法杀伤胶质瘤负载DC疫苗诱导Th17抗肿瘤免疫并提供胶质瘤预后4基因特征
该数据集来自NCBI，主题为转录组或基因表达，属于肿瘤/脑肿瘤分类。研究围绕负载经光敏剂光动力疗法诱导免疫原性细胞死亡的胶质瘤细胞的树突状细胞疫苗，分析其转录程序，探讨其诱导Th17抗肿瘤免疫的疗效与分子机制，并识别可用于预测患者总生存期的可靠预后基因特征
基本信息
资源简介
PRJNA902288：光动力疗法杀伤胶质瘤负载DC疫苗诱导Th17抗肿瘤免疫并提供胶质瘤预后4基因特征
PRJNA902288 数据集来自 NCBI，主题为转录组或基因表达，归属于肿瘤 / 脑肿瘤分类。该研究围绕负载经光敏剂光动力疗法（PS-PDT）诱导免疫原性细胞死亡（ICD）的胶质瘤细胞的树突状细胞（DC）疫苗展开，通过分析该 ICD 基 DC 疫苗的转录程序，探讨其诱导 Th17 抗肿瘤免疫的疗效与分子机制，并识别可用于预测患者总生存期（OS）的可靠预后基因特征。胶质瘤是成人中枢神经系统最常见的原发性肿瘤，具有显著的发病率与死亡率，尽管已有新型、复杂、多学科及靶向治疗手段，胶质瘤治疗在过去数十年间进展有限，因此亟需开发能够主动刺激抗肿瘤 T 细胞、产生长期记忆并带来显著临床获益的新型个体化免疫疗法。该数据集为相关转录组研究提供了数据支撑。
【数据集背景】
胶质瘤是成人中枢神经系统中最常见的原发性肿瘤类型，伴随显著的发病率与死亡率。尽管新型、复杂、多学科以及靶向治疗不断出现，胶质瘤治疗在过去数十年中并未取得大幅进展。因此，迫切需要开发新型的、针对患者调整的免疫疗法，以主动刺激抗肿瘤 T 细胞、产生长期记忆，从而带来显著的临床获益。在此背景下，本研究旨在探究负载经光敏剂光动力疗法（PS-PDT）诱导免疫原性细胞死亡（ICD）的胶质瘤细胞的树突状细胞（DC）疫苗的疗效与分子机制，并识别能够可靠预测患者总生存期（OS）的预后基因特征。对基于 ICD 的 DC 疫苗转录程序的分析，进一步导向了相关预后特征的识别。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，即转录组或基因表达。其研究内容涉及对负载经光敏剂光动力疗法诱导免疫原性细胞死亡的胶质瘤细胞的树突状细胞疫苗进行转录程序分析，以探讨该疫苗诱导 Th17 抗肿瘤免疫的疗效与分子机制，并识别可用于预测患者总生存期的可靠预后基因特征。数据集英文名称中包含“provide a 4-gene signature for glioma prognosis”，表明研究涉及一个 4 基因特征用于胶质瘤预后。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、数据文件类型与规模等更具体的数据内容描述。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。其英文名称为 PRJNA902288: DC vaccines loaded with glioma killed by photodynamic therapy induce Th17 anti-tumor immunity and provide a 4-gene signature for glioma prognosis。除来源站与数据集名称外，源站未提供关于采集时间、采集地点、样本处理流程、测序方法等具体采集信息。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤 / 脑肿瘤领域的转录组或基因表达研究，尤其是围绕胶质瘤免疫治疗方向。具体而言，可用于研究与负载经光敏剂光动力疗法诱导免疫原性细胞死亡的胶质瘤细胞的树突状细胞疫苗相关的转录程序，探讨其诱导 Th17 抗肿瘤免疫的疗效与分子机制，并可用于识别和验证预测胶质瘤患者总生存期的预后基因特征。对于关注胶质瘤新型个体化免疫疗法、免疫原性细胞死亡机制以及预后标志物发掘的研究者，该数据集具有潜在的参考价值。除上述方向外，源站未提供其他具体适用场景说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、分析流程、软件工具或代码等均未在给定信息中说明。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、批次效应、样本量或潜在偏倚等方面的具体信息。已知限制在于，该数据集归属于肿瘤 / 脑肿瘤分类，主题为转录组或基因表达，其研究结论与适用范围需结合具体研究设计与数据特征加以判断。除源站描述所提及的内容外，未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA902288
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
胶质瘤是成人中枢神经系统最常见的原发性肿瘤，具有显著的发病率和死亡率。尽管新型、复杂、多学科和靶向治疗不断发展，但胶质瘤治疗在过去几十年中并未取得太大进展。因此，迫切需要开发新的、根据患者调整的免疫疗法，主动刺激抗肿瘤T细胞产生长期记忆，从而带来显著的临床获益。本研究旨在探讨负载经光敏剂光动力疗法（PS-PDT）诱导免疫原性细胞死亡（ICD）的胶质瘤细胞的树突状细胞（DC）疫苗的疗效和分子机制，并确定可靠的预后基因特征以预测患者的总生存期（OS）。对基于ICD的DC疫苗转录程序的分析确定了其作为疫苗使用时Th17特征的强烈诱导，这些DC在原位小鼠模型中显示出维甲酸受体相关孤儿受体-γt依赖性疗效。
此外，通过将基于ICD的DC疫苗的转录组程序与TCGA低级别胶质瘤（LGG）数据集的转录组数据进行对比分析，已鉴定出与胶质瘤患者总生存期（OS）相关的四基因特征（CFH、GALNT3、SMC4、VAV3）。该模型已在CGGA-LGG、TCGA-胶质母细胞瘤（GBM）和CGGA-GBM数据集的OS中得到验证，以确定其是否具有相似的预后价值。为此，通过计算时间依赖性受试者工作特征（ROC）曲线的曲线下面积（AUC），评估了该预后模型预测OS的敏感性和特异性。对于TCGA-LGG、CGGA-LGG、TCGA-GBM和CGGA-GBM，预测5年生存率的AUC值分别为0.75、0.73、0.9和0.69。这些数据为通过采用基于ICD和PS-PDT的DC疫苗诱导
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
