MGMT-STP27甲基化状态作为间变性少突胶质瘤和少突星形细胞瘤对PCV治疗反应的预测标志物：EORTC 26951研究
目的：EORTC-26951 试验的长期随访结果显示，放疗后加用 PCV 可提高间变性少突胶质瘤/少突星形细胞瘤（AOD/AOA）患者的生存率
基本信息
资源简介
MGMT-STP27甲基化状态作为间变性少突胶质瘤和少突星形细胞瘤对PCV治疗反应的预测标志物：EORTC 26951研究
PRJNA210232 数据集围绕间变性少突胶质瘤与间变性少突星形细胞瘤（AOD/AOA）中 MGMT-STP27 甲基化状态作为 PCV 治疗反应预测标志物这一主题展开。该数据集来源于 EORTC 26951 研究，旨在探索放疗后加用 PCV 化疗能否提高患者生存率，以及哪些患者更可能从 PCV 治疗中获益。研究对纳入 EORTC-26951 试验的 115 个样本进行了全基因组甲基化谱分析，提取了 CpG 岛高甲基化表型（CIMP）和 MGMT 启动子甲基化（MGMT-STP27）状态。该数据集属于肿瘤/脑肿瘤分类，来源站为 ebi.ac.uk，可为神经肿瘤领域的甲基化标志物研究、治疗反应预测及生存分析提供数据支持。
【数据集背景】
EORTC-26951 试验的长期随访结果显示，在放疗后加用 PCV 可提高间变性少突胶质瘤/少突星形细胞瘤（AOD/AOA）患者的生存率。然而，部分患者从 PCV 治疗中获得的获益似乎大于其他患者。为探究这种差异是否与肿瘤的甲基化特征相关，研究团队开展了全基因组甲基化谱分析，并重点关注 CpG 岛高甲基化表型（CIMP）和 MGMT 启动子甲基化（MGMT-STP27）状态。该数据集即基于这一研究背景产生，目标是将 MGMT-STP27 甲基化状态作为 PCV 治疗反应的预测标志物进行评价。
【数据内容】
该数据集包含对 115 个样本进行的全基因组甲基化谱分析结果，并从中提取了 CIMP 和 MGMT-STP27 状态。研究首先证明，甲基化谱分析可以在存档组织上进行，其表现与新鲜冷冻组织样本相似。随后，研究对 EORTC-26951 临床试验样本进行了甲基化谱分析。单因素分析表明，CIMP+ 或 MGMT-STP27 甲基化的肿瘤，与 CIMP- 和/或 MGMT-STP27 未甲基化的肿瘤相比，生存期有所改善。源站描述在此处未完整给出后续内容，因此更详细的统计结果、具体生存指标及多因素分析结论未在现有信息中呈现。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，属于肿瘤/脑肿瘤分类。样本来自 EORTC-26951 临床试验，共 115 个样本。研究对存档组织与新鲜冷冻组织均进行了甲基化谱分析，并比较了两者的表现。除上述信息外，关于样本采集时间、采集地点、伦理审批、知情同意及具体实验平台等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于神经肿瘤学中甲基化标志物相关的研究，尤其是间变性少突胶质瘤和间变性少突星形细胞瘤的治疗反应预测与生存分析。具体而言，可用于探索 CIMP 状态和 MGMT-STP27 甲基化状态与 PCV 治疗获益之间的关系，也可用于方法学比较，例如评估存档组织与新鲜冷冻组织在甲基化谱分析中的表现差异。此外，该数据集还可为后续验证 MGMT-STP27 作为预测标志物的研究提供参考。
【使用方法】
源站未提供具体的数据使用说明、访问权限、下载方式或分析流程。用户如需使用该数据集，应参考来源站 ebi.ac.uk 上该数据集的官方页面及相关发表文献，以获取数据格式、预处理步骤和分析建议。由于现有信息未涵盖数据访问条款和技术文档，无法在此给出进一步的操作指引。
【质量与限制】
该数据集的一个已知优势是，甲基化谱分析可在存档组织上进行，且其表现与新鲜冷冻组织样本相似，这为利用临床试验存档样本开展回顾性研究提供了支持。研究样本量为 115 个，来自 EORTC-26951 试验。单因素分析显示 CIMP+ 或 MGMT-STP27 甲基化与生存改善相关。然而，源站描述未完整呈现多因素分析、具体效应量、置信区间及随访细节，因此无法全面评估该数据集的统计效力与泛化能力。此外，关于数据缺失情况、批次效应、平台差异及质量控制指标，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、许可协议或使用限制。用户在使用前应查阅 ebi.ac.uk 上该数据集的官方页面，以确认正确的引用方式和许可条件。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA210232
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
目的：EORTC-26951试验的长期随访结果显示，放疗后加用PCV可提高间变性少突胶质细胞瘤/少突星形细胞瘤（AOD/AOA）患者的生存率。然而，部分患者似乎比其他患者更能从PCV治疗中获益。实验设计：我们对纳入EORTC-26951试验的115份样本进行了全基因组甲基化谱分析，并提取了CpG岛高甲基化表型（CIMP）和MGMT启动子甲基化（MGMT-STP27）状态。结果：我们首先证明，甲基化谱分析可在存档组织上进行，其表现与速冻组织样本相似。随后，我们对EORTC-26951临床试验样本进行了甲基化谱分析。单因素分析表明，与CIMP-和/或MGMT-STP27未甲基化的肿瘤相比，CIMP+或MGMT-STP27甲基化的肿瘤生存期改善（中位总生存期（OS）分别为1.05年 vs. 6.46年，以及1.06年 vs. 3.8年，CIMP和MGMT-STP27状态的P值均<0.0001）。
多变量分析表明，在模型中包含年龄、性别、体能评分和复核诊断的情况下，CIMP和MGMT-STP27是显著的生存预后因素。多变量分析表明，CIMP和MGMT-STP27状态是不依赖于年龄、性别、体能评分和复核诊断的生存预后因素。CIMP+和MGMT-STP27甲基化的肿瘤显示出从辅助PCV化疗中明确获益：在RT和RT-PCV组中，CIMP+样本的中位OS分别为3.27年和9.51年，P=0.0033；对于MGMT-STP27甲基化样本，分别为1.98年和8.65年。对于CIMP-或MGMT-STP27未甲基化的肿瘤，则没有这种获益。MGMT-STP27状态在交互作用检验中仍具有显著性（P=0.003）。微阵列的统计分析（SAM）识别出259个与治疗反应相关的新CpG位点。结论：MGMT-STP27可用于指导该肿瘤类型的治疗决策。总体设计：亚硫酸
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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