甲硫氨酸限制饮食对小鼠高级别胶质瘤染色质可及性影响（3xCr）[scATAC-seq]

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甲硫氨酸限制饮食对小鼠高级别胶质瘤染色质可及性影响（3xCr）[scATAC-seq]

PRJNA1467525 数据集聚焦于甲硫氨酸限制饮食对小鼠高级别胶质瘤染色质可及性的影响，采用单细胞 ATAC 测序（scATAC-seq）技术，对来自免疫健全小鼠高级别胶质瘤模型皮层肿瘤组织的样本进行检测。研究中，动物分别维持对照饮食或甲硫氨酸限制饮食，以考察饮食干预对肿瘤活力及染色质可及性的作用。该数据集有助于刻画肿瘤微环境中响应甲硫氨酸限制的染色质重塑与调控景观变化，属于肿瘤/脑肿瘤分类下的表观基因组学数据，来源于 NCBI。

【数据集背景】

高级别胶质瘤是发生于脑部的高恶性度肿瘤。该数据集围绕饮食干预与肿瘤表观遗传调控之间的关联展开，关注甲硫氨酸限制饮食对肿瘤活力及染色质可及性的影响。研究以免疫健全小鼠为模型，在高级别胶质瘤背景下比较对照饮食与甲硫氨酸限制饮食两种条件，旨在通过单细胞层面的染色质可及性信息，揭示肿瘤微环境中的染色质重塑和调控景观变化。数据集主题标签为表观基因组学，所属分类为肿瘤/脑肿瘤。

【数据内容】

该数据集的核心数据为单细胞 ATAC 测序（scATAC-seq）数据，检测对象为从免疫健全小鼠高级别胶质瘤模型皮层分离的肿瘤组织。实验设计中，3xCr 小鼠在出生后第 21 天（P21）断奶，并被置于甲硫氨酸限制（MetR）饮食或对照饮食条件下饲养；至 P50 时处死动物，从皮层解剖 GFP 阳性肿瘤组织。随后由单细胞悬液分离细胞核，并进行单细胞 ATAC 测序。数据可用于表征肿瘤微环境中染色质重塑及调控景观的变化。样本数量、测序深度、细胞数等具体指标源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述表明，scATAC-seq 实验在免疫健全小鼠高级别胶质瘤模型的肿瘤组织上进行，动物分别接受对照饮食或甲硫氨酸限制饮食。组织采集时间点为出生后第 50 天（P50），采集部位为皮层 GFP 阳性肿瘤。细胞核从单细胞悬液中分离后进入单细胞 ATAC 测序流程。除上述实验流程信息外，样本采集地点、伦理审批信息及具体测序平台等源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究甲硫氨酸限制饮食对高级别胶质瘤肿瘤微环境染色质可及性的影响，可用于分析饮食干预条件下肿瘤细胞及微环境内染色质重塑和调控景观的变化。其单细胞 ATAC 测序特性使其适合在单细胞分辨率下考察染色质可及性差异。具体可支持的深入分析方向及验证性应用，源站未提供。

【使用方法】

该数据集为单细胞 ATAC 测序数据，使用时应结合对照饮食与甲硫氨酸限制饮食两组条件进行比较分析，关注肿瘤组织来源的 GFP 阳性细胞核的染色质可及性特征。数据下载方式、文件格式、预处理流程及分析工具等源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于免疫健全小鼠高级别胶质瘤模型，实验条件包括对照饮食与甲硫氨酸限制饮食，组织来源为皮层 GFP 阳性肿瘤，检测方法为单细胞 ATAC 测序。关于数据质量指标、批次信息、重复数量、测序覆盖度及潜在偏倚等，源站未提供。使用时应注意到该数据来源于小鼠模型，向其他物种或临床场景的外推需谨慎。

【引用与许可】

该数据集的引用方式与许可信息源站未提供。