少突胶质前体细胞发育及对致癌组蛋白H3.3 K27M反应的细胞自主区域差异[ChIP-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE310474

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数据说明

弥漫性中线胶质瘤（DMG）是一种发生于脑干和中线结构的不治之症。大多数DMG携带组蛋白H3错义突变，即第27位赖氨酸被甲硫氨酸取代（H3 K27M）。H3 K27M突变几乎仅见于DMG，其区域选择性的机制尚不清楚。本研究利用条件性敲入小鼠模型，探究H3.3 K27M在胚胎期GFAP+神经干细胞中对出生后不同脑区的致癌效应。我们发现，H3.3 K27M以区域特异性方式减少少突胶质细胞分化，并在体内按脑区增加不同祖细胞状态的出生后增殖，选择性扩增腹侧脑桥的少突胶质细胞谱系。对原代区域特异性小鼠OPC培养物进行的细胞形态学、标志物表达及转录组分析表明，野生型脑干与前脑OPC的分化动态存在细胞内在差异。

H3.3 K27M驱动脑干来源OPC细胞自主性增殖增加，并破坏固有区域特异性转录程序，延迟前脑来源OPC的分化并限制脑干来源OPC的完全成熟。H3.3 K27M介导的变化包括Bmp、Wnt和Notch通路中与DMG发病机制相关基因的脑干选择性上调。我们的发现揭示，H3.3 K27M差异性破坏细胞自主性区域少突胶质细胞发育，这可能为脑干选择性胶质瘤发生提供一个机会窗口。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。