弥漫性低级别星形细胞瘤细胞系LGG275中静息态(P27+)与分裂态(P27-)胶质瘤细胞的分子特征与性质探究

星形细胞瘤已知呈现细胞异质性,由三种已识别的亚群组成:“星形细胞样”、“少突胶质细胞样”和“NPC样”细胞。研究还表明,它们包含一个静息亚群,即神经G0细胞,占肿瘤细胞的90%以上

ena
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文本分类肿瘤脑肿瘤星形细胞瘤胶质瘤静息细胞P27mVenusLGG275
PRJNA1310597: Explore the molecular profile and properties of quiescent (P27+) and mitotic (P27-) glioma cell in diffuse low grade astrocytoma cell lines LGG275

基本信息

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创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

弥漫性低级别星形细胞瘤细胞系LGG275中静息态(P27+)与分裂态(P27-)胶质瘤细胞的分子特征与性质探究

PRJNA1310597 数据集聚焦于弥漫性低级别星形细胞瘤细胞系 LGG275 中静息态(P27+)与分裂态(P27-)胶质瘤细胞的分子特征与属性探索。星形细胞瘤已知呈现细胞异质性,由“星形细胞样”、“少突胶质细胞样”和“NPC样”三种已识别亚群组成,同时还包含一个静息亚群,即神经 G0 细胞,占肿瘤细胞的 90% 以上。由于这类静息细胞难以分离,其特性长期不明确。该数据集利用 Oki 等人(2014)构建的 mVenus/P27 载体表达系统,通过 P27 与 mVenus 融合来标记 LGG275 细胞系中的静息细胞,并据此分选 mVenus/P27 表达阳性(静息)与阴性(分裂)细胞,以探索两个群体的属性并验证 mVenus/P27 工具的有效性。该数据集归类于肿瘤/脑肿瘤方向,来源为 ebi.ac.uk。

【数据集背景】

星形细胞瘤是脑肿瘤研究中的重要对象,其细胞异质性已被广泛关注。已知其包含“星形细胞样”、“少突胶质细胞样”和“NPC样”三种亚群,此外还存在一个静息亚群,即神经 G0 细胞,占肿瘤细胞的 90% 以上。然而,由于静息细胞难以被分离,其具体属性一直不清晰。LGG275 是一种生长缓慢的星形细胞瘤细胞系,为研究这类静息细胞提供了模型。Oki 等人(2014)构建了 mVenus/P27 载体,将 P27 与 mVenus 融合,用于在 LGG275 细胞系中高亮显示静息细胞。该数据集正是基于这一报告系统,旨在探索静息(P27+)与分裂(P27-)胶质瘤细胞的分子谱与属性,并验证 mVenus/P27 工具。

【数据内容】

该数据集围绕 LGG275 细胞系展开,涉及静息态(P27+)与分裂态(P27-)两种胶质瘤细胞群体。实验设计包括用含有 mVenus/P27 构建体的慢病毒感染 LGG275 细胞,随后利用该报告系统分选 mVenus/P27 表达细胞(静息)与不表达细胞(分裂)。数据集的目标是探索这两个群体的属性,并验证 mVenus/P27 工具。源站描述中未提供具体的分子谱数据、测序深度、样本数量或分析结果等细节。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,英文名称为 PRJNA1310597: Explore the molecular profile and properties of quiescent (P27+) and mitotic (P27-) glioma cell in diffuse low grade astrocytoma cell lines LGG275。根据源站描述,研究使用了 Oki 等人(2014)构建的 mVenus/P27 载体,通过慢病毒感染 LGG275 细胞,并利用该报告系统进行细胞分选。源站未提供样本采集地点、时间、伦理审批或具体实验平台等信息。

【适用场景】

该数据集适用于研究弥漫性低级别星形细胞瘤中静息态与分裂态胶质瘤细胞的分子特征与属性,尤其关注神经 G0 细胞(静息细胞)的生物学特性。它可用于验证 mVenus/P27 报告系统在标记和分选静息细胞方面的有效性,也可为探索星形细胞瘤细胞异质性、静息细胞在肿瘤中的角色以及相关分子机制提供数据支持。此外,该数据集可能对脑肿瘤研究、肿瘤细胞周期与静息状态研究具有参考价值。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明。通常,此类数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取,用户可根据数据集标识 PRJNA1310597 进行检索和下载。具体的数据格式、访问权限、分析流程或工具要求,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、覆盖度、准确性或技术限制的详细信息。已知的限制包括静息细胞难以分离,但该研究通过 mVenus/P27 报告系统尝试克服这一困难。其他质量指标与限制条件,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。

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源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA1310597

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

星形细胞瘤已知呈现细胞异质性,由三种已识别的亚群组成:“星形细胞样”、“少突胶质细胞样”和“NPC样”细胞。研究还表明,它们包含一个静息或神经G0细胞亚群,占肿瘤细胞的90%以上。由于难以分离这些细胞,其特性仍不清楚。我们使用了Oki等人(2014)构建的mVenus/P27载体表达系统,其中P27与mVenus融合,以在LGG275细胞系——一种生长缓慢的星形细胞瘤——中标记静息细胞。随后,我们利用该报告系统分选表达mVenus/P27的细胞(静息)和阴性细胞(有丝分裂),旨在探索这两个群体的特性并验证mVenus/P27工具。总体设计:LGG275细胞被含有mVenus/P27构建体的慢病毒感染,其中mVenus与P27融合。然后,根据mVenus的表达对细胞进行分选。mVenus阳性细胞为P27阳性(静息)细胞。mVenus阴性细胞为P27阴性(有丝分裂)细胞。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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