泛TEAD共价抑制剂在Hippo依赖性癌症模型中阻断YAP活性并显示脑渗透性[RNA-seq]
数据涉及共价pan-TEAD抑制剂阻断YAP活性并在Hippo依赖性癌症模型中展示脑渗透性的研究,同时源站标题指向弥漫性中线胶质瘤中CAR-T细胞疗效的强直信号编码
![PRJNA1304856: Covalent pan-TEAD inhibitors block YAP activity and demonstrate brain penetrance in Hippo-dependent cancer models [RNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/170668.jpg)
基本信息
资源简介
泛TEAD共价抑制剂在Hippo依赖性癌症模型中阻断YAP活性并显示脑渗透性[RNA-seq]
A Tonic Signaling Code Governs CAR-T Cell Efficacy in Diffuse Midline Glioma
该数据集来自NCBI,包含1个文件(GSE305987_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱分析,物种为人类(9606),平台为GPL34281。数据涉及共价pan-TEAD抑制剂阻断YAP活性并在Hippo依赖性癌症模型中展示脑渗透性的研究,同时源站标题指向弥漫性中线胶质瘤中CAR-T细胞疗效的强直信号编码。可用于肿瘤脑转移、Hippo通路及CAR-T治疗相关基因表达分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 21 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):弥漫性中线胶质瘤(DIPG/DMG)是一种 uniformly 致命的儿童脑肿瘤。尽管CAR T细胞疗法前景广阔,但临床反应仍不一致,主要由于CAR-T持久性有限和过早耗竭。缺乏可靠的生物标志物来预测治疗疗效,而提出的T细胞耗竭或干性标志物预测价值有限。在此,我们系统评估针对临床相关肿瘤抗原B7-H3的CAR-T细胞,并确定强直信号(抗原非依赖性CAR激活)是治疗性能的关键决定因素。具有最小强直信号的B7-H3 CAR-T细胞在患者来源的DIPG模型中显示出优越的肿瘤杀伤、持久性和抗耗竭能力。整合单细胞和多组学分析识别出一个强直信号相关基因特征,该特征始终优于传统的耗竭或干
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34281、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305987
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 05 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
TEAD蛋白是一类转录因子家族,能够使失调的Hippo信号通路发挥致癌活性,是肿瘤学中一个有前景的治疗靶点。靶向TEAD的脂质口袋是抑制辅因子YAP和TAZ致癌活性的既定途径。在此,我们介绍两种结合脂质口袋的共价泛TEAD抑制剂:GNE-8025和GNE-2181。GNE-8025通过共价结合TEAD蛋白上一个保守的半胱氨酸残基来占据脂质口袋,并以变构方式破坏TEAD蛋白与YAP的相互作用。GNE-2181是GNE-8025的进一步优化版本,其特性使其能够在体内穿透血脑屏障。这两种小分子均能在体外和体内抑制YAP驱动的肿瘤细胞增殖,并增强多种MAPK通路抑制剂的活性。我们证明,这些分子在Hippo驱动的体内肿瘤模型中具有卓越的疗效,包括在脑转移小鼠模型中,GNE-2181治疗显著抑制了颅内脑肿瘤的生长。总之,我们提出了一类下一代TEAD抑制剂。
GNE-8025和GNE-2181的开发是朝着强效、特异且有效的靶向Hippo癌症疗法迈出的重要一步。总体设计:每6孔板接种200,000个细胞,用化合物处理48小时。联合单药处理条件:1 μM化合物+0.01% DMSO。最终文库使用Agilent Technologies TapeStation 2200系统(High Sensitivity D1000,货号5067-5584)进行定量。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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