44例毛细胞型星形细胞瘤1Mb分辨率aCGH分析

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44例毛细胞型星形细胞瘤1Mb分辨率aCGH分析

毛细胞型星形细胞瘤（pilocytic astrocytomas，PAs）属于WHO I级肿瘤，是最常见的儿童脑肿瘤之一。该数据集围绕一组毛细胞型星形细胞瘤样本，采用1Mb分辨率的微阵列比较基因组杂交（array-based comparative genomic hybridisation，aCGH）技术，对44例肿瘤中的拷贝数变化进行分析。数据集英文名称为“PRJNA106777: Array-based comparative genomic hybridisation analysis at 1Mb resolution of 44 pilocytic astrocytomas”，在站内归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向，来源站为ebi.ac.uk。整体设计为每个病例进行单次杂交，共分析44例WHO I级毛细胞型星形细胞瘤，目标（肿瘤）样本以Cy5标记，参照样本以Cy3标记，并使用20例正常男性或女性基因组DNA的混合物进行性别不匹配杂交。

【数据集背景】

毛细胞型星形细胞瘤（PAs）为WHO I级，是最常见的儿童脑肿瘤之一。围绕这一肿瘤类型，研究者关注其基因组层面的拷贝数变化。该数据集正是基于这一背景，利用微阵列比较基因组杂交（aCGH）在1Mb分辨率下对毛细胞型星形细胞瘤开展分析，以刻画该肿瘤系列中的拷贝数改变情况。数据集关键词包括Comparative Genomic Hybridization与aCGH，指向其核心方法学定位。

【数据内容】

该数据集包含对44例毛细胞型星形细胞瘤（WHO I级）的aCGH分析结果。整体设计为每个病例进行单次杂交，即单次杂交对应单个病例。检测目标为肿瘤样本中的拷贝数变化，分辨率达到1Mb。样本总数为44例，均属于WHO I级毛细胞型星形细胞瘤。关于具体样本的临床信息、年龄、性别分布、肿瘤部位、随访数据以及原始数据文件的具体格式与数量，源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于ebi.ac.uk。实验采用微阵列比较基因组杂交（aCGH）技术，在1Mb分辨率下进行。杂交方案中，目标（肿瘤）样本使用Cy5标记，参照样本使用Cy3标记。参照样本为20例正常男性或女性基因组DNA的混合物，并采用性别不匹配杂交策略。整体设计为每个病例单次杂交。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息以及具体的实验操作流程细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究毛细胞型星形细胞瘤（WHO I级）中的拷贝数变化，尤其适合在1Mb分辨率下进行全基因组范围的拷贝数变异分析。由于毛细胞型星形细胞瘤是最常见的儿童脑肿瘤之一，该数据可用于探索该肿瘤类型的基因组特征。其aCGH设计也可用于方法学比较、拷贝数变化模式识别，以及作为儿童脑肿瘤基因组研究的参考数据之一。关于该数据集在特定临床诊断、预后判断或治疗指导中的直接应用，源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时，可基于单次杂交对应单个病例的设计，对44例毛细胞型星形细胞瘤的aCGH结果进行拷贝数变化分析。分析中需注意目标（肿瘤）样本标记为Cy5，参照样本标记为Cy3，且参照为20例正常男性或女性基因组DNA的混合物，并采用性别不匹配杂交。数据处理可围绕1Mb分辨率下的拷贝数变化展开。关于具体的分析软件、归一化方法、统计阈值、数据下载格式及访问流程，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的分析分辨率为1Mb，意味着对小于该尺度的拷贝数变化可能无法精细识别。样本量为44例，均来自毛细胞型星形细胞瘤（WHO I级），整体设计为每个病例单次杂交。参照样本为20例正常男性或女性基因组DNA的混合物，并采用性别不匹配杂交。关于数据质量评估指标、重复实验情况、批次效应、样本纳入排除标准以及潜在的混杂因素，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为ebi.ac.uk，英文名称为“PRJNA106777: Array-based comparative genomic hybridisation analysis at 1Mb resolution of 44 pilocytic astrocytomas”。关于具体的引用文献、作者列表、许可协议、使用条款及数据共享政策，源站未提供。