PRJEB94540：U87细胞RNA转录组分析
该数据集包含人胶质瘤细胞系U87的三组RNA转录组测序数据，分别为野生型U87细胞、过表达磷脂酶Cβ4（PLCB4）的U87细胞及相应对照空载体U87细胞，每组设有生物学重复，采用高通量测序技术捕获不同处理条件下的全转录本表达谱
基本信息
资源简介
PRJEB94540：U87细胞RNA转录组分析
PRJEB94540 数据集聚焦于人胶质瘤细胞系 U87 的 RNA 转录组测序分析，涵盖野生型 U87 细胞、过表达磷脂酶 Cβ4（PLCB4）的 U87 细胞以及相应的空载体对照 U87 细胞三组样本。每组细胞均设置了生物学重复，并借助高通量测序技术获取不同处理条件下的全转录本表达谱。该数据集旨在为研究 PLCB4 基因在 U87 细胞中的表达调控机制、相关信号通路及其在胶质瘤发生发展中的潜在作用提供基础数据支持，可服务于差异基因表达分析、功能富集分析和调控网络构建等后续研究。数据集归属于肿瘤 / 脑肿瘤分类，来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据集背景】
胶质瘤是中枢神经系统常见的肿瘤类型，U87 细胞系是研究胶质瘤生物学行为的常用体外模型。磷脂酶 Cβ4（PLCB4）作为一种信号转导相关分子，其在胶质瘤细胞中的表达调控作用及潜在机制值得深入探索。该数据集通过转录组测序手段，系统比较野生型 U87 细胞、PLCB4 过表达 U87 细胞及空载体对照 U87 细胞之间的全转录本表达差异，为揭示 PLCB4 基因在 U87 细胞中的功能及其与胶质瘤发生发展的关联提供数据基础。
【数据内容】
数据集包含三组 RNA 转录组测序数据：野生型 U87 细胞组、过表达 PLCB4 的 U87 细胞组以及相应的空载体对照组。每组细胞均设有生物学重复，以确保数据具备可重复性和统计可靠性。测序采用高通量测序技术，捕获上述不同处理条件下细胞的全转录本表达谱，覆盖整体转录表达信息，可用于后续的差异表达比较与表达模式分析。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为 PRJEB94540: Transcriptomic analysis of RNA in U87 cells。样本材料为人胶质瘤细胞系 U87，涉及野生型、PLCB4 过表达及空载体对照三种处理条件。测序策略为 RNA 转录组高通量测序，具体测序平台、读长、测序深度及建库细节源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于以下研究方向：差异基因表达分析，比较 PLCB4 过表达组与对照组、野生型组之间的转录本表达变化；功能富集分析，对差异表达基因进行通路与功能层面的注释挖掘；调控网络构建，基于表达谱推断 PLCB4 相关的基因调控关系；以及围绕 PLCB4 基因在 U87 细胞中的表达调控机制、相关信号通路及其在胶质瘤发生发展中潜在作用的探索性研究。
【使用方法】
使用时可依据样本分组信息（野生型、PLCB4 过表达、空载体对照）进行组间比较，结合生物学重复开展差异表达统计检验；随后可对差异基因集进行功能富集与通路分析，并在此基础上构建候选调控网络。具体数据下载方式、文件格式、参考基因组版本及分析流程参数源站未提供。
【质量与限制】
数据集每组均设有生物学重复，采用高通量测序获取全转录本表达谱，具备开展组间比较的基本条件。关于测序质量值、重复一致性、批次效应评估及数据过滤标准等质量指标，源站未提供。该数据基于 U87 细胞系体外模型，其结果向临床或其他胶质瘤模型的推广需谨慎对待；具体适用范围与验证要求源站未提供。
【引用与许可】
数据来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名称为 PRJEB94540: Transcriptomic analysis of RNA in U87 cells。具体引用文献、作者信息、数据许可协议及使用条款源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB94540
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含人胶质瘤细胞系U87的三组RNA转录组测序数据，具体包括：野生型U87细胞、过表达磷脂酶Cβ4（PLCB4）的U87细胞以及相应的空载体对照U87细胞。每个细胞系组均设有生物学重复，采用高通量测序技术捕获不同处理条件下细胞的全转录表达谱。本数据集旨在为研究PLCB4基因在U87细胞中的表达调控机制、相关信号通路及其在胶质瘤发生发展中的潜在作用提供基础数据支持，可用于差异基因表达分析、功能富集分析及调控网络构建等后续研究。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
