四种胶质母细胞瘤细胞系经照射、PARP7i、diABZI单独或联合照射处理的RNA-seq
该数据集来自NCBI,包含四种胶质母细胞瘤(GBM)细胞系(U251、T98G、GB-1、KALS-1)的RNA-seq数据,这些细胞系接受了大分割X射线照射(3x8 Gy)、PARP7i、diABZI单独或与照射联合处理

基本信息
资源简介
四种胶质母细胞瘤细胞系经照射、PARP7i、diABZI单独或联合照射处理的RNA-seq
该数据集来自NCBI,包含四种胶质母细胞瘤(GBM)细胞系(U251、T98G、GB-1、KALS-1)的RNA-seq数据,这些细胞系接受了大分割X射线照射(3x8 Gy)、PARP7i、diABZI单独或与照射联合处理。GBM是免疫冷肿瘤,具有免疫抑制微环境,对放疗、化疗和免疫治疗均耐药。数据可用于研究放疗与STING激动剂、DNA损伤应答抑制剂联合应用后cGAS/STING和I型干扰素通路介导的免疫原性反应,探索GBM免疫增敏机制(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):胶质母细胞瘤(GBM)是最致命的脑癌类型,不仅对放疗和化疗等传统治疗耐药,也对现代免疫治疗耐药。GBM被归类为免疫冷肿瘤,具有免疫抑制微环境。已有研究表明,放疗和化疗可改变肿瘤微环境,并通过cGAS/STING和I型干扰素(IFN-I)通路在包括乳腺癌、肺癌和结直肠癌在内的多种癌症中触发抗肿瘤免疫反应。此外,STING激动剂以及DNA损伤应答和细胞周期检查点抑制剂可促进免疫刺激性胞质dsDNA的积累,从而增强放疗效果。在此,我们检测了四种不同GBM细胞系(U251、T98G、GB-1、KALS-1)在大分割X射线照射(3x8 Gy)联合
【主题与分类】
主题标签:Other。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB85939
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB85939
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
胶质母细胞瘤(GBM)是最致命的脑癌类型,不仅对放疗和化疗等传统疗法表现出耐药性,对现代免疫治疗也同样具有抵抗性。GBM被归类为免疫“冷”肿瘤,具有免疫抑制性微环境。研究表明,放疗和化疗能够改变肿瘤微环境,并通过cGAS/STING和I型干扰素(IFN-I)通路在包括乳腺癌、肺癌和结直肠癌在内的多种癌症中触发抗肿瘤免疫应答。此外,STING激动剂以及DNA损伤应答和细胞周期检查点抑制剂——这些药物可促进免疫刺激性胞质双链DNA的积累——已被发现能够增强放疗效果。在本研究中,我们检测了四种不同GBM细胞系(U251、T98G、GB-1、KALS-1)在大分割X射线照射(3×8 Gy)联合STING激动剂或靶向免疫信号通路的抑制剂(PARP7)时的免疫原性应答。我们对所有四种GBM细胞系分别接受3×8 Gy、PARP7i、diABZI单独处理或与3×8 Gy联合处理后的样本进行了RNA-seq分析。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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