替莫唑胺处理的胶质母细胞瘤细胞系RNA-Seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB115611

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究包含三种人胶质母细胞瘤细胞系（LN229、A172和U251）在反复暴露于替莫唑胺（TMZ）后的RNA测序数据。细胞用150 μM TMZ处理72小时，随后在无药培养基中培养96小时。该处理周期持续重复两周。未处理的对照细胞在标准条件下培养。从生物学重复样本中提取总RNA，并由Novogene使用Illumina RNA测序进行测序。本研究旨在探究反复TMZ暴露诱导的转录组变化，并鉴定与细胞对烷化剂治疗反应相关的基因表达变化。数据集包括未处理对照（每种细胞系三个生物学重复）和TMZ处理样本（A172，n=3；LN229，n=2；U251，n=4）。处理组重复数不等反映了测序前未达到RNA完整性质量标准的样本被排除。实验未包括对获得性TMZ耐药性的验证；因此，该数据集代表的是对反复TMZ暴露的转录组反应，而非细胞中已确认的TMZ耐药性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。