PRJDB15806:脑肿瘤血液小RNA生物标志物

开发无创生物标志物有望改善当前脑肿瘤患者的管理。在本研究中,我们利用下一代测序分析了血液中小RNA(如miRNA、转运RNA衍生片段(tRF)和长非编码RNA(lncRNA)衍生片段)的全局表达谱

ena
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基因组预测脑肿瘤血液生物标志物小RNAmiRNAtRFlncRNA衍生片段下一代测序
PRJDB15806: Blood small RNA biomarker for brain tumors

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

PRJDB15806:脑肿瘤血液小RNA生物标志物

PRJDB15806 是一个聚焦于脑肿瘤血液小RNA生物标志物的数据集,来源于 ebi.ac.uk,在分类上归属于肿瘤 / 脑肿瘤方向。该数据集围绕脑肿瘤患者管理中无创生物标志物开发这一目标而建立,研究内容涉及利用下一代测序技术分析血液中小RNA的全局表达谱,所关注的小RNA类型包括 miRNA、转运RNA衍生片段(tRF)以及长非编码RNA(lncRNA)衍生片段。其研究目标涵盖胶质瘤、胶质母细胞瘤和原发性中枢神经系统淋巴瘤等脑肿瘤的诊断,同时也着眼于开发面向脑肿瘤患者的预测性和预后性血液生物标志物,以期为建立更优的脑肿瘤患者管理体系提供支持。

【数据集背景】

脑肿瘤患者的当前管理方式有待改善,而开发无创生物标志物被认为是改进这一现状的重要途径。基于此,本研究项目旨在通过血液样本中的小RNA表达信息,探索可用于脑肿瘤诊断、预测和预后的生物标志物。项目关注的脑肿瘤类型包括胶质瘤、胶质母细胞瘤以及原发性中枢神经系统淋巴瘤。研究期望通过血液生物标志物的建立,推动脑肿瘤患者管理体系的完善。

【数据内容】

该数据集的核心内容是血液中小RNA的全局表达谱,涵盖 miRNA、转运RNA衍生片段(tRF)和长非编码RNA(lncRNA)衍生片段等小RNA类型。这些表达谱数据通过下一代测序技术获得,用于支撑脑肿瘤相关血液生物标志物的开发研究。数据所对应的研究目标既包括脑肿瘤的诊断性生物标志物,也包括针对脑肿瘤患者的预测性和预后性生物标志物。

【采集与来源】

数据集来源于 ebi.ac.uk。根据源站描述,研究通过下一代测序分析血液中小RNA的全局表达谱,样本类型为血液。关于样本采集的具体地点、时间范围、采集流程以及样本量等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于脑肿瘤无创生物标志物相关的研究场景,尤其是围绕血液小RNA表达谱开展脑肿瘤诊断、预测和预后标志物探索的工作。其研究覆盖的脑肿瘤类型包括胶质瘤、胶质母细胞瘤和原发性中枢神经系统淋巴瘤。数据集可用于支持对 miRNA、tRF 和 lncRNA 衍生片段等小RNA类型的表达分析,服务于脑肿瘤患者管理改进这一总体目标。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB15806

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

开发无创生物标志物有望改善脑肿瘤患者的现有管理。本研究利用下一代测序技术分析了血液中小RNA的整体表达谱,包括miRNA、转运RNA衍生片段(tRF)以及长链非编码RNA(lncRNA)衍生片段。本项目旨在开发用于诊断脑肿瘤(如胶质瘤、胶质母细胞瘤和原发性中枢神经系统淋巴瘤)的血液生物标志物。我们还致力于开发针对脑肿瘤患者的预测性和预后性血液生物标志物。本研究将有助于建立更完善的脑肿瘤患者管理体系。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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