儿童脑肿瘤脑脊液蛋白质组学潜在生物标志物数据集（EVD来源）

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD022512

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑肿瘤是儿童期最常见的实体肿瘤。目前需要用于检测残留病灶、治疗反应及复发的生物标志物。脑脊液（CSF）是脑肿瘤生物标志物的来源之一。我们分析了30例患有不同类型脑肿瘤的儿童及16例因无关原因需行脑室外引流（EVD）的对照者废弃CSF的蛋白质组。在对照组和脑肿瘤患者的CSF中分别鉴定出1598和1526种蛋白质，其中263和191种蛋白质分别为两种状态所独有。生物信息学分析揭示了有前景的生物标志物用于区分对照组与肿瘤组（TATA结合蛋白相关因子15和S100蛋白B）。此外，胸腺素β-4（TMSB4X）和CD109，以及14.3.3和HSP90α可区分其他脑肿瘤与低级别胶质瘤加胶质神经元肿瘤/毛细胞型星形细胞瘤，或胚胎性肿瘤/髓母细胞瘤。生物标志物通过ELISA测定进行了验证。我们的方法似乎能够区分两组肿瘤，并能将每组肿瘤与正常及出血患者队列区分开来。

进一步的前瞻性研究可评估我们发现方法所提出的生物标志物能否在其他体液中以更少侵入性的方式被识别，以及这些标志物是否有助于指导治疗和预测复发。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。