POG_patient_42880 样本数据集

该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Pediatric Personalized Onco-Genomics 研究,包含一名 H3K27 突变型弥漫性中线胶质瘤患者的基因组与转录组测序数据

omicsdi
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基因组分类Genomics
POG_patient_42880 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

POG_patient_42880 样本数据集

POG_patient_42880 - samples 是一个聚焦于脑肿瘤方向的肿瘤基因组数据集,来源于 omicsdi.org。该数据集收录的是一名 H3K27 突变型弥漫性中线胶质瘤患者的基因组与转录组测序数据,属于 BC Cancer Agency 开展的 Pediatric Personalized Onco-Genomics 研究的一部分。从主题标签来看,该数据集以 Genomics 为核心,整体定位是为儿童肿瘤的个性化基因组研究提供原始或衍生的测序样本信息。对于关注儿童脑肿瘤、特别是弥漫性中线胶质瘤分子特征的科研人员而言,该数据集提供了一个以单例患者为单位的基因组与转录组数据实例。

【数据集背景】

该数据集产生于 BC Cancer Agency 的 Pediatric Personalized Onco-Genomics 研究。该研究的名称表明其面向儿科患者,并以个性化肿瘤基因组学为方向。数据集所对应的患者诊断为弥漫性中线胶质瘤,且带有 H3K27 突变。弥漫性中线胶质瘤是脑肿瘤中的一种类型,而 H3K27 突变是该类肿瘤中具有分子分型意义的特征之一。该数据集正是围绕这一特定患者,采集其基因组与转录组层面的测序信息,用于支撑相关研究。关于该研究项目的整体设计、入组标准、伦理审批信息等,源站未提供。

【数据内容】

该数据集包含来自一名 H3K27 突变型弥漫性中线胶质瘤患者的基因组与转录组序列数据。基因组测序数据可用于分析该患者肿瘤在 DNA 层面的变异情况,转录组测序数据则可用于反映基因表达层面的信息。数据集名称中的“samples”提示其内容与样本层面的数据组织有关。除上述基因组与转录组序列数据这一概括性描述外,关于具体测序平台、测序深度、覆盖范围、样本数量、文件格式、数据体积等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org,原始数据由 BC Cancer Agency 的 Pediatric Personalized Onco-Genomics 研究产生。数据集对应的患者为一名弥漫性中线胶质瘤患者,其肿瘤带有 H3K27 突变。关于样本采集的具体时间、地点、采集流程、样本类型(如肿瘤组织或对照组织)、处理方法等,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容,该数据集可应用于与儿童脑肿瘤相关的基因组学研究场景,尤其是针对弥漫性中线胶质瘤及 H3K27 突变的研究。研究人员可将其用于探索该患者肿瘤的基因组变异特征与转录组表达特征,也可作为个性化肿瘤基因组学研究的单例数据参考。由于该数据集属于 Pediatric Personalized Onco-Genomics 研究的一部分,其适用场景也与儿科个性化肿瘤基因组分析相关。关于该数据集在其他具体研究方向的适用性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 POG_patient_42880 - samples 为名称,可通过来源站 omicsdi.org 获取相关入口信息。关于数据的具体下载方式、访问权限、所需工具、分析流程、参考基因组版本等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Pediatric Personalized Onco-Genomics 研究,包含一名 H3K27 突变型弥漫性中线胶质瘤患者的基因组与转录组序列数据。其最明显的限制在于以单例患者为对象,样本规模有限。关于数据质量评估指标、测序质量、数据完整性、批次效应、污染控制等信息,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001015326

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自一名弥漫性中线胶质瘤、H3K27突变患者,作为BC癌症机构儿童个性化肿瘤基因组学研究的一部分所生成的基因组和转录组序列数据。

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