ONC201联合paxalisib治疗H3K27变异型弥漫性中线胶质瘤数据集
该数据集来源于ebi.ac.uk,主题为ONC201联合paxalisib治疗H3K27变异型弥漫性中线胶质瘤,并涉及缺乏H3-K27M突变、以H3K27me3缺失和EZHIP过表达为特征的新DMG亚群

基本信息
资源简介
ONC201联合paxalisib治疗H3K27变异型弥漫性中线胶质瘤数据集
Histone H3 wild-type DIPG/DMG overexpressing EZHIP extend the spectrum diffuse midline gliomas with PRC2 inhibition beyond H3-K27M mutation
该数据集来源于ebi.ac.uk,主题为ONC201联合paxalisib治疗H3K27变异型弥漫性中线胶质瘤,并涉及缺乏H3-K27M突变、以H3K27me3缺失和EZHIP过表达为特征的新DMG亚群。数据基于Human Methylation microarray的甲基化谱分析,物种为Homo sapiens。可用于研究EZHIP/H3-WT肿瘤与经典DIPG/DMG的相似性,以及PRC2抑制在H3-K27M突变之外的DMG谱系扩展,支持分子分型与相关分类任务(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):描述了一个缺乏H3-K27M突变的新DMG亚群,其特征为H3K27me3缺失和EZHIP过表达,可通过IHC检测。这些肿瘤与EZHIP阳性的后颅窝室管膜瘤不同,且预后极差。我们提出,这些EZHIP/H3-WT肿瘤需要被视为与经典DIPG/DMG相似,从而将PRC2抑制的DMG谱系扩展到H3-K27M突变之外。
【主题与分类】
主题标签:Human - Methylation microarray、methylation profiling by array、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-8888
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
Thomas Kergrohen; David Castel; Jacques Grill (2020). Histone H3 wild-type DIPG/DMG overexpressing EZHIP extend the spectrum diffuse midline gliomas with PRC2 inhibition beyond H3-K27M mutation [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-8888
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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