儿童脑肿瘤microRNA表达谱
该数据集来自omicsdi.org,收录了57例儿童脑肿瘤的microRNA表达谱,覆盖多种病理类型,包括毛细胞型星形细胞瘤、弥漫性星形细胞瘤、间变性星形细胞瘤、胶质母细胞瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、非典型畸胎样/横纹肌样瘤、脉络丛乳头状瘤和乳头状胶质神经元肿瘤,并包含7例成人脑对照

基本信息
资源简介
儿童脑肿瘤microRNA表达谱
该数据集英文名为 MicroRNA expression profiles for paediatric brain tumours,来源于 omicsdi.org,属于肿瘤 / 脑肿瘤分类,主题标签为 Transcriptomics。数据集收录了 57 例儿童脑肿瘤的 microRNA 表达谱,覆盖多种病理类型,包括毛细胞型星形细胞瘤、弥漫性星形细胞瘤、间变性星形细胞瘤、胶质母细胞瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、非典型畸胎样/横纹肌样瘤、脉络丛乳头状瘤和乳头状胶质神经元肿瘤,并包含 7 例成人脑对照。该数据集可用于比较儿童脑肿瘤与正常成人脑组织之间的 microRNA 表达差异,为相关转录组学研究提供表达谱数据基础。
【数据集背景】
该数据集围绕儿童脑肿瘤的 microRNA 表达特征展开。研究者在同一项研究中筛选了一个包含 57 例儿童脑肿瘤的队列,这些肿瘤涵盖广泛的病理类型,目的是识别其 microRNA 表达谱。研究设计还将儿童脑肿瘤的 microRNA 表达谱与正常成人脑组织进行比较分析,从而在儿童肿瘤样本与成人对照之间建立对照关系。这一背景说明该数据集的核心价值在于以转录组学视角刻画不同病理类型儿童脑肿瘤的 microRNA 表达情况。
【数据内容】
数据集的内容为 microRNA 表达谱,属于转录组学数据。样本构成包括 57 例儿童脑肿瘤和 7 例成人脑对照。在儿童脑肿瘤部分,具体病理类型及例数为:14 例毛细胞型星形细胞瘤、3 例弥漫性星形细胞瘤、2 例间变性星形细胞瘤、5 例胶质母细胞瘤、14 例室管膜瘤、9 例髓母细胞瘤、5 例非典型畸胎样/横纹肌样瘤、4 例脉络丛乳头状瘤、1 例乳头状胶质神经元肿瘤。上述样本覆盖了从低级别胶质瘤到高级别胶质瘤、胚胎性肿瘤、室管膜肿瘤及脉络丛肿瘤等多种病理类别,并配有成人脑对照样本,便于开展组间比较。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述表明,研究者在一项研究中筛选了 57 例儿童脑肿瘤样本,这些样本具有广泛的病理类型,用于识别 microRNA 表达谱,并将儿童脑肿瘤的 microRNA 表达谱与正常成人脑组织进行比较。关于样本采集地点、采集时间、测序平台、建库方法及数据处理流程等具体信息,源站未提供。
【适用场景】
基于其样本构成与转录组学主题,该数据集适用于儿童脑肿瘤 microRNA 表达谱的探索性分析,例如比较不同病理类型肿瘤之间以及肿瘤与成人正常脑组织之间的 microRNA 表达差异;也可用于围绕毛细胞型星形细胞瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤等特定病理类别开展表达特征归纳。由于数据主题标签为 Transcriptomics,其典型用途属于转录组层面的表达谱研究。关于该数据集在其他具体研究场景中的验证性用途,源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 omicsdi.org 获取,具体下载方式、文件格式、数据组织结构和分析流程等,源站未提供。使用时应以源站提供的原始描述和样本构成信息为准,注意区分儿童脑肿瘤样本与成人脑对照样本,并按病理类型对样本进行分组。
【质量与限制】
该数据集的样本量在各病理类型之间分布不均衡,例如乳头状胶质神经元肿瘤仅 1 例,间变性星形细胞瘤 2 例,而毛细胞型星形细胞瘤和室管膜瘤各 14 例;对照样本为成人脑组织而非儿童正常脑组织。关于数据质量评估、批次效应、归一化处理及技术验证等信息,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式与许可信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-42657
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在本研究中,我们筛选了57例儿童脑肿瘤队列,涵盖多种病理类型,以鉴定microRNA表达谱。我们分析了儿童脑肿瘤与正常成人脑组织相比的microRNA表达谱。我们的队列包括14例毛细胞型星形细胞瘤、3例弥漫性星形细胞瘤、2例间变性星形细胞瘤、5例胶质母细胞瘤、14例室管膜瘤、9例髓母细胞瘤、5例非典型畸胎样/横纹肌样瘤、4例脉络丛乳头状瘤、1例乳头状胶质神经元肿瘤以及7例成人脑对照。
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