RNA脂质颗粒聚集体对小鼠脑肿瘤模型肿瘤微环境的影响

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A337d912cb180f3fbb102307aeae61e975ff199fdd9c25f8470f96e3075d4fe6f

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

携带KR158b-luc颅内肿瘤的小鼠接受了以下任一处理：脂质颗粒、负载沉默RNA的脂质颗粒聚集体（modRNA-LPA）或负载非沉默RNA的脂质颗粒聚集体。处理后二十四小时，将肿瘤组织保存于RNAlater中，随后进行RNA提取。之后，样品被送至诺禾致源（Novogene），通过Poly(A)捕获法进行文库制备。测序在Illumina NovaSeq 6000平台上进行，采用双端150 bp测序方法。用于处理的RNA由亲本KR158b-luc细胞系提取的总RNA合成。在用于体外转录（IVT）反应之前，先通过RT-PCR生成cDNA文库，随后进行RNA纯化以获得纯化的mRNA抗原。非沉默RNA使用ThermoFisher Scientific IVT试剂盒（货号AM1344）制备，而沉默RNA则使用CellScript IVT试剂盒（货号C-ICTAMY110510）生成。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。