Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 肿瘤与人 AT/RT 基因表达特征相似
数据比较 Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 小鼠肿瘤与 Ptc1+/- 小鼠髓母细胞瘤，并借助可区分人 AT/RT 与人髓母细胞瘤的基因表达特征进行分析
基本信息
资源简介
Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 肿瘤与人 AT/RT 基因表达特征相似
Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre tumors and human AT/RT show similar gene expression signatures
该数据集来自 NCBI GEO（GSE68627），包含 1 个文件 GSE68627_series_matrix.txt.gz，属于表达谱芯片数据，物种为小鼠（10090），平台为 GPL19559。数据比较 Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 小鼠肿瘤与 Ptc1+/- 小鼠髓母细胞瘤，并借助可区分人 AT/RT 与人髓母细胞瘤的基因表达特征进行分析。可用于研究 AT/RT 与髓母细胞瘤在基因表达层面的差异，以及小鼠模型与人肿瘤表达特征的相似性（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：May 06 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：人类髓母细胞瘤（MB）可根据基因表达模式分为四大类：Hedgehog（HH）亚型、Wnt 亚型、Group 3 和 Group 4。然而，它们的基因表达谱均与不典型畸胎样/横纹肌样瘤（AT/RT）显著不同。我们重新分析了已发表的儿童脑肿瘤基因表达微阵列数据集，以鉴定能够清晰区分人 AT/RT 与人 MB 的基因表达谱。我们使用该表达谱，仅选择具有明确小鼠直系同源基因的基因，将来自 Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 小鼠（C57Bl/6 品系背景）的肿瘤与来自 Ptc1+/- 小鼠（C57Bl/6 与 129Sv 混合品系背景）的 MB 进行比较。Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 肿瘤与小鼠 MB 明显非常不同，而区分人 AT/RT 与人 MB 的标志物同样能区分这些小鼠肿瘤。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL19559、10090。本站分类：肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE68627
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 11 201，引用时请注意版本时效。
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE68627
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
人类髓母细胞瘤（MB）根据基因表达模式可分为四大类：Hedgehog（HH）亚型、Wnt亚型、第3组和第4组。然而，它们与不典型畸胎样/横纹肌样瘤（AT/RT）的基因表达谱存在显著差异。我们重新分析了已发表的儿童脑肿瘤基因表达微阵列数据集，以识别能够清晰区分人类AT/RT与人类MB的基因表达特征。利用这一特征，我们仅选择具有明确小鼠同源基因的基因，比较了来自Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre小鼠（C57Bl/6品系背景）的肿瘤与来自Ptc1+/-小鼠（C57Bl/6和129Sv混合品系背景）的MB。Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre肿瘤与小鼠MB明显不同，而区分人类AT/RT与人类MB的标志物同样能区分小鼠肿瘤。
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