五个原发性人胶质母细胞瘤的拷贝数数据(冷冻手术切除)
数据基于五个原发性人胶质母细胞瘤的冷冻手术切除样本,采用 genome tiling array 进行基因组变异分析,平台为 GPL9128,物种为 9606

基本信息
资源简介
五个原发性人胶质母细胞瘤的拷贝数数据(冷冻手术切除)
Copy number data from five primary human glioblastomas (frozen surgical resection)
该数据集来自 NCBI,标题为 Copy number data from five primary human glioblastomas (frozen surgical resection),属于肿瘤/脑肿瘤分类。数据基于五个原发性人胶质母细胞瘤的冷冻手术切除样本,采用 genome tiling array 进行基因组变异分析,平台为 GPL9128,物种为 9606。源站描述指出 DNA 低甲基化可能导致 GBM 中替代启动子激活,研究对同一批样本进行了全基因组 DNA 甲基化和 H3K4me3 分析,并完成表达与拷贝数分析。数据集包含 1 个文件,样例为 GSE49808_series_matrix.txt.gz,可用于。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 12 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):DNA 低甲基化可能导致 GBM 中替代启动子的激活。我们对同一批样本进行了全基因组 DNA 甲基化和 H3K4me3 分析,并完成了表达和拷贝数分析。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL9128、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE49808
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 14 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE49808
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
DNA低甲基化可能导致GBM中替代启动子的激活。我们全基因组范围内分析了DNA甲基化和H3K4me3,并对相同样本进行了表达和拷贝数分析。在此数据集中,我们包含了为五个GBM获取的所有阵列CGH拷贝数数据。我们利用估计的拷贝数来标准化基于测序的甲基化数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




