五例原发人胶质母细胞瘤与一例非肿瘤成人脑的表达数据
该数据集来自 NCBI GEO,包含五例原发人胶质母细胞瘤(冷冻手术切除)与一例非肿瘤成人脑(冷冻尸检组织)的表达谱数据,采用芯片表达谱分析,平台为 GPL15648,物种为人(9606)

基本信息
资源简介
五例原发人胶质母细胞瘤与一例非肿瘤成人脑的表达数据
Expression data from five primary human glioblastomas (frozen surgical resection) and one non-neoplastic adult brain (frozen autopsy tissue)
该数据集来自 NCBI GEO,包含五例原发人胶质母细胞瘤(冷冻手术切除)与一例非肿瘤成人脑(冷冻尸检组织)的表达谱数据,采用芯片表达谱分析,平台为 GPL15648,物种为人(9606)。源站描述指出 DNA 低甲基化可能导致 GBM 中替代启动子激活,研究者对同一批样本进行了全基因组 DNA 甲基化与 H3K4me3 分析,并完成表达与拷贝数分析。数据可用于胶质母细胞瘤与非肿瘤脑组织的表达差异比较及相关分类研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 31 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):DNA 低甲基化可能导致 GBM 中替代启动子激活。我们对同一批样本进行了全基因组 DNA 甲基化和 H3K4me3 分析,并进行了表达和拷贝数分析
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL15648、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE49412
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 02 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE49412
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
DNA低甲基化可能导致GBM中替代启动子的激活。我们对全基因组的DNA甲基化和H3K4me3进行了分析,并对相同样本进行了表达和拷贝数分析。在这个数据集中,我们包括了五个GBM和一个正常大脑的所有表达数据。我们识别了GBM中同时发生DNA低甲基化和H3K4me3的位点,并利用这些数据分析了同一样本中最近基因的表达。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




