嗜铬细胞瘤与副神经节瘤肿瘤样本表达数据
该数据集来自 NCBI GEO,包含嗜铬细胞瘤(PHEO)与副神经节瘤(PGL)肿瘤样本的表达谱数据,使用 Human HuGene1.0-ST Gene Chips 检测,共纳入 8 例正常肾上腺髓质和 45 例 PHEO/PGL 患者样本

基本信息
资源简介
嗜铬细胞瘤与副神经节瘤肿瘤样本表达数据
Expression data from pheochromocytoma (PHEO) and paraganglioma (PGL) tumor samples
该数据集来自 NCBI GEO,包含嗜铬细胞瘤(PHEO)与副神经节瘤(PGL)肿瘤样本的表达谱数据,使用 Human HuGene1.0-ST Gene Chips 检测,共纳入 8 例正常肾上腺髓质和 45 例 PHEO/PGL 患者样本。数据可用于比较肿瘤与正常组织的表达差异,并支持基于基因表达谱的样本分类或基因型相关差异分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 30 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):使用 Human HuGene1.0-ST Gene Chips 评估了基因型特异的表达谱差异。本数据集包含来自 8 例正常肾上腺髓质和 45 例 PHEO/PGL 患者样本的表达数据。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL6244、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE39716
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 26 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE39716
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
已使用人类HuGene1.0-ST基因芯片评估基因型特异性的表达谱差异。本数据集包含来自8例正常肾上腺髓质和45例PHEO/PGL患者样本的表达数据。从病灶中心采集外观存活的组织并速冻用于RNA提取。45例PHEO/PGL样本均在切除后经病理学家检查。携带SDHB突变的患者PKh_27和PKh_28为同一患者,样本取自不同时间的两个不同部位。所有病例均经组织病理学确诊为PHEO/PGL。组织按遗传/综合征背景及肿瘤部位分为SDHB组(n = 18)、SDHD-A/T组(n = 6)、SDHD-HN组(n = 8)和VHL组(n = 13)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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