RNA疫苗接种驱动实验性胶质母细胞瘤中TCR-T细胞扩增与脑许可

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE343695

标准获取流程：

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数据说明

采用嵌合抗原受体（CAR）或T细胞受体（TCR）转基因T（TCR-T）细胞的过继性细胞疗法在实体瘤，尤其是脑肿瘤中的疗效有限。脑肿瘤过继性T细胞疗法的一个主要挑战是难以接触到靶抗原，而靶抗原是再次刺激和维持持久性所必需的。这对TCR-T细胞尤为重要。在此，我们通过将TCR-T与编码同源抗原的mRNA疫苗相结合，在两种实验性胶质瘤模型中诱导体内对过继转移的TCR-T细胞的再次刺激，从而克服了这一挑战。通过脂质复合物介导将编码免疫优势MHC I类卵清蛋白表位SIINFEKL的mRNA递送至脾脏树突状细胞，引发了过继转移的卵清蛋白特异性OT1 CD8+ T细胞的强烈扩增，最高可达所有循环CD8+ T细胞的80%，并转化为显著改善的T细胞浸润以及对表达卵清蛋白的实验性胶质母细胞瘤的控制。

转录组分析显示，该疫苗在脾脏免疫细胞中触发了I型干扰素反应，使OT1 T细胞获得许可浸润脑内肿瘤，并在脑中维持其干扰素刺激基因特征。为在实验模型中测试这一首创TCR-T细胞疗法的治疗策略，我们使用了TCT-001——一种源自患者的TCR，靶向人胶质母细胞瘤干性抗原蛋白酪氨酸受体磷酸酶受体Z1型（PTPRZ1）中受HLA-A2限制的免疫优势表位，目前正在进行GMP生产以用于临床应用。在小鼠模型中，静脉过继转移TCT-001后，共给予转染PTPRZ1-mRNA的人树突状细胞可导致表达PTPRZ1的人胶质瘤被排斥。总之，我们的模型表明，mRNA疫苗能够增强针对胶质母细胞瘤的TCR-T细胞疗法。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。