甲硫氨酸可用性驱动巨噬细胞中m⁶A依赖的PPARG调控促进胶质母细胞瘤免疫抑制

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE343158

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数据说明

胶质母细胞瘤（GBM）的特征是富含甲硫氨酸的代谢微环境和免疫抑制性巨噬细胞的广泛浸润。尽管肿瘤代谢与免疫抑制密切相关，但甲硫氨酸可利用性升高影响巨噬细胞功能的机制仍不完全清楚。在本研究中，我们探讨了高甲硫氨酸环境是否改变巨噬细胞中N6-甲基腺苷（m6A）RNA修饰，从而调控巨噬细胞的抗肿瘤免疫。使用佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯（PMA）将THP-1细胞分化为巨噬细胞样细胞，随后在正常甲硫氨酸条件下培养或用0.8 mM甲硫氨酸处理48小时。采用Arraystar Human m6A-mRNA&lncRNA Epitranscriptomic Microarray分析来表征全转录组范围内m6A修饰的变化，并鉴定与高甲硫氨酸诱导的巨噬细胞抗肿瘤免疫功能改变相关的候选调控因子。这些数据是研究胶质母细胞瘤中巨噬细胞介导的免疫抑制的甲硫氨酸/m6A调控轴的一部分。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。