GSE342072：胞质ATM通过维持TBK1-IRF3信号限制胶质母细胞瘤细胞中溶瘤VSVΔ51复制

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE342072

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

ATM是一种具有肿瘤抑制功能的核DNA损伤应答激酶，但其在病毒感染过程中的细胞质功能仍知之甚少。在此，我们发现细胞质ATM是一种限制溶瘤病毒（OVs）复制的抗病毒因子。溶瘤VSVΔ51感染可触发ATM依赖CRM1的核输出，产生与含病毒dsRNA复合物相结合的细胞质ATM。阻断ATM核输出或抑制ATM可减弱I型干扰素诱导，从而允许病毒复制。机制上，细胞质ATM与TBK1的泛素样结构域相互作用并维持TBK1-IRF3信号传导。ATM抑制增强了溶瘤细胞毒性并促进癌细胞中的免疫原性细胞死亡。在多种肿瘤模型中，ATM的药理学抑制或基因缺失与VSVΔ51协同抑制肿瘤生长、延长小鼠生存期并促进持久的抗肿瘤免疫。这些发现揭示了ATM在抗病毒先天免疫中的细胞质功能，并将其确定为改善溶瘤病毒治疗的治疗脆弱性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。