U251N原位胶质母细胞瘤异种移植大鼠MRI引导LITT前后bulk RNA-seq

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE338105

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

激光间质热疗（LITT）越来越多地用于深部及复发性胶质母细胞瘤，但在亚致死性热半暗带中存活并导致复发的细胞的转录状态尚不明确。我们对接受MRI引导下LITT治疗的胸腺缺陷RNU/RNU大鼠中U251N原位异种移植瘤的配对原发（LITT前）和复发（LITT后）肿瘤进行了bulk RNA-seq。使用xengsort将reads分选为人（移植物）和大鼠（宿主）两个数据流，以从宿主信号中分离出人肿瘤转录组。复发肿瘤表现出显著的翻译停滞和整合应激反应激活，并向Garofano线粒体分子亚型转变，提示翻译/ISR轴可作为LITT辅助治疗的候选靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。