胶质母细胞瘤生存相关miRNA特征NGS鉴定数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335138

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

采用下一代测序（NGS）技术，对5例GBM-STS患者、8例GBM-LTS患者的肿瘤脑组织样本，以及4例低级别胶质瘤（I–II级）患者的外周肿瘤区域样本（作为对照组）进行miRNA表达谱比较。使用单因素方差分析（ANOVA）进行差异表达分析，以评估各组间miRNA表达的整体差异。若miRNA满足绝对倍数变化（|FC|）≥ 2且错误发现率（FDR）≤ 0.05的标准，则被认为具有显著差异表达。在GBM-STS与对照组的比较中，共鉴定出23个具有差异表达且具有生物学相关性的miRNA（12个上调，11个下调）；在GBM-LTS与对照组的比较中鉴定出18个（6个上调，12个下调）；在GBM-STS与GBM-LTS的比较中鉴定出16个（12个上调，4个下调）。为验证NGS结果，选取三个差异表达miRNA进行RT-qPCR分析，包括在GBM-STS与

GBM-LTS比较。使用Mann–Whitney U检验进行的统计分析发现，与GBM-LTS和对照样本相比，GBM-STS样本中hsa-miR-424-5p和hsa-miR-216a-5p的表达水平显著升高，而hsa-miR-133a-3p的表达显著降低。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。