CD70靶向CAR-T治疗胶质母细胞瘤后免疫景观重塑的单细胞RNA测序

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE330539

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数据说明

嵌合抗原受体（CAR）-T细胞疗法在胶质母细胞瘤（GB）中的疗效有限，很大程度上归因于免疫抑制性肿瘤微环境（TME）。我们和其他研究者此前已证明，基于配体的mCD70靶向构建体mCAR27在体外特异性清除CD70⁺ GB细胞，并在同基因原位GB模型中诱导持久肿瘤缓解及延长生存期。尽管CD70作为GB CAR-T细胞靶点具有治疗前景，但靶向CD70的CAR-T细胞在靶点拦截后对脑肿瘤免疫景观的影响仍未被探索。在此，我们应用单细胞RNA测序（scRNAseq）解析接受局部mCAR27治疗的CD70+ GB免疫健全小鼠中GB浸润免疫细胞的转录组。mCAR27细胞治疗扩增了过继转移的细胞，并与内源性Cd8⁺ T细胞浸润增加相关，同时免疫抑制性群体减少，包括Tregs和M2样巨噬细胞，但也包括树突状细胞和自然杀伤细胞的亚群。

在多种浸润GB的免疫亚群中检测到CD70表达，尤其是Tregs和M2样巨噬细胞，这为其耗竭提供了合理的机制基础。在转录水平上，mCAR27介导的GB清除导致I型干扰素刺激基因和免疫抑制介质（如Arg1、Tgfbi、Cd274、Pdcd1lg2和Lag3）的协同下调，同时上调参与炎症消退的基因，这些发现与GB来源的炎症应激减弱相一致。互补的bulk RNA测序和体内实验独立证实了CD70在小鼠GB中的促肿瘤作用。总体而言，我们展示了靶向CD70的CAR-T细胞疗法将治疗后免疫景观重塑为炎症消退和免疫抑制减少的状态，从而支持持续的免疫监视。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。