靶向磷脂酰丝氨酸抑制肿瘤细胞RNA-seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329207

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脂质代谢的改变在癌症中经常被观察到，在肿瘤细胞的存活和增殖中起着关键作用。磷脂酰丝氨酸（PS）是真核细胞膜中带负电荷最多的甘油磷脂，在哺乳动物中由磷脂酰丝氨酸合酶1（PTDSS1）等关键酶合成。在此，我们发现了食管鳞状细胞癌（ESCC）和胶质母细胞瘤（GBM）中一种依赖PS的代谢脆弱性。药理学抑制PTDSS1能以纳摩尔级效力有效抑制肿瘤生长。机制上，PS耗竭导致PS和磷脂酰乙醇胺（PE）的代谢性耗竭，触发内质网（ER）应激并激活自噬。这些发现揭示了肿瘤细胞活力中一种此前未被认识的依赖PS的代谢依赖性，表明靶向PS合成可能为抑制肿瘤细胞提供一种有前景的治疗方法。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。