KPNA3通过上调MGMT并激活STAT3维持胶质瘤干细胞驱动替莫唑胺耐药
该数据集来自NCBI GEO,包含1个高通量测序表达谱文件(GSE327029_series_matrix.txt.gz),聚焦胶质母细胞瘤对替莫唑胺的耐药机制

基本信息
资源简介
KPNA3通过上调MGMT并激活STAT3维持胶质瘤干细胞驱动替莫唑胺耐药
KPNA3 drives temozolomide resistance in glioblastoma by upregulating MGMT and activating STAT3 to sustain glioma stem cells
该数据集来自NCBI GEO,包含1个高通量测序表达谱文件(GSE327029_series_matrix.txt.gz),聚焦胶质母细胞瘤对替莫唑胺的耐药机制。研究通过整合替莫唑胺耐药胶质瘤细胞SF126R与患者数据库的生物信息学分析,发现KPNA3在耐药背景下表达升高并与预后不良相关;功能实验显示敲低KPNA3可削弱恶性行为、恢复TMZ诱导凋亡敏感性并抑制胶质瘤干细胞特性。数据可用于耐药相关表达分析及预后标志物探索(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 06 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):胶质母细胞瘤(GBM)不可避免地会对一线化疗药物替莫唑胺(TMZ)产生耐药,导致治疗失败。这种耐药背后的分子机制仍不完全清楚。在此,我们将核转运蛋白α亚基3(KPNA3)鉴定为TMZ耐药的一种新型关键驱动因子。通过对替莫唑胺耐药胶质瘤细胞(SF126R)和患者数据库进行整合生物信息学分析,我们发现KPNA3在TMZ耐药背景下表达升高,并与接受TMZ治疗患者的不良预后相关。功能研究表明,在耐药细胞中敲低KPNA3可损害恶性行为,使细胞对TMZ诱导的凋亡重新敏感,并抑制胶质瘤干细胞(GSC)特性,包括成球能力和干性因子(OCT4、ALDH1A1)的表达。在机制上,KPNA3通过双重途径促进耐药
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL29480、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327029
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 17 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327029
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
胶质母细胞瘤(GBM)不可避免地会对替莫唑胺(TMZ)这一一线化疗药物产生耐药性,导致治疗失败。这种耐药性的分子机制目前仍未完全阐明。在本研究中,我们鉴定出核转运蛋白α亚基3(KPNA3)是TMZ耐药性的一个新发现的关键驱动因子。通过对替莫唑胺耐药胶质瘤细胞(SF126R)和患者数据库的综合生物信息学分析,我们发现KPNA3在TMZ耐药情境下表达升高,并与接受TMZ治疗患者的不良预后相关。功能研究表明,在耐药细胞中敲低KPNA3可削弱其恶性行为,使细胞重新对TMZ诱导的凋亡敏感,并抑制胶质瘤干细胞(GSC)特性,包括成球能力和干性因子(OCT4、ALDH1A1)的表达。在机制上,KPNA3通过双重途径促进耐药性:它上调DNA修复酶MGMT的表达并激活STAT3信号通路。敲低KPNA3可降低MGMT水平和STAT3磷酸化(Tyr705)。
此外,对STAT3的药理学抑制模拟了KPNA3敲低的效果,能够强效抑制GSC的生成。在临床样本中,高级别胶质瘤组织中KPNA3与p-STAT3蛋白水平呈正相关。综上所述,我们的研究揭示了KPNA3作为一个核心调控因子,同时增强DNA修复并维持GSC群体,从而促进TMZ耐药,表明其是克服GBM化疗耐药的一个有前景的治疗靶点。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




