IDH突变型1p/19q共缺失少突胶质细胞瘤小鼠模型 [sample_049-60]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE326991

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

少突胶质细胞瘤是一种原发性中枢神经系统肿瘤，根据异柠檬酸脱氢酶（IDH）突变和1p/19q共缺失进行分类。在此，我们描述了利用子宫内电穿孔技术生成IDH突变型1p/19q共缺失少突胶质细胞瘤小鼠模型的方法。我们确定了IDH1R132H、PIK3CAE545K、CicKO、Fubp1KO和Cdkn2aKO为最佳组合（称为OligoCdkn2a），能够驱动完全外显的肿瘤，其组织学特征类似于人类II/III级IDH突变型、1p/19q共缺失少突胶质细胞瘤。在该小鼠模型中，用Trp53缺失替代Cdkn2a使肿瘤组织学转向高级别星形细胞瘤。OligoCdkn2a肿瘤显示出与IDH和CIC突变相关的代谢和转录变化，单细胞测序鉴定出与IDH野生型胶质母细胞瘤小鼠模型相比，其偏向于少突胶质细胞分化。OligoCdkn2a肿瘤代表了首个重现人类IDH突变型1p/19q共缺失少突胶质细胞瘤遗传、组织学和转录特征的小鼠模型系统，为进一步剖析肿瘤生物学和测试新的治疗策略提供了一个平台。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。