胶质母细胞瘤瘤内异质性研究 [scRNA-seq]

该数据集来自 NCBI GEO,标题为胶质母细胞瘤瘤内异质性研究,采用单细胞 RNA 测序表达谱分析,包含 1 个文件(GSE326397_series_matrix.txt.gz),物种为小鼠(GPL24247,10090)

geo
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基因组分类GPL2424710090
GSE326397: A study for intratumoral heterogeneity of glioblastoma [scRNA-seq]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

胶质母细胞瘤瘤内异质性研究 [scRNA-seq]

A study for intratumoral heterogeneity of glioblastoma [scRNA-seq]

该数据集来自 NCBI GEO,标题为胶质母细胞瘤瘤内异质性研究,采用单细胞 RNA 测序表达谱分析,包含 1 个文件(GSE326397_series_matrix.txt.gz),物种为小鼠(GPL24247,10090)。源站描述指出该研究通过多组学分析建立基于五基因特征的 gITH 分类器,高 gITH 肿瘤分子复杂性增强,PDLIM4 被确定为与干样特性和不良临床结局相关的核心调控因子,功能验证显示敲低 PDLIM4 可抑制 ITH 与肿瘤进展。数据可用于胶质母细胞瘤异质性量化与预后预测相关研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 30 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):瘤内异质性(ITH)是胶质母细胞瘤(GBM)治疗耐药的关键驱动因素。本研究通过多组学分析建立了基于五基因特征的 gITH 分类器,证明其具有稳健的预后预测价值。高 gITH 肿瘤表现出增强的分子复杂性,PDLIM4 被确定为与干样特性和不良临床结局强相关的核心调控因子。功能验证证实,敲低 PDLIM4 可抑制 ITH 和肿瘤进展。我们的工作不仅建立了基于转录组的 GBM 异质性量化框架,还揭示 PDLIM4 是一个有前景的治疗靶点,为精准医学提供了新策略。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE326397

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 02 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE326397

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤内异质性(ITH)是胶质母细胞瘤(GBM)治疗耐药的关键驱动因素。本研究通过多组学分析建立了基于五基因特征的gITH分类器,展现出稳健的预后预测价值。高gITH肿瘤表现出增强的分子复杂性,其中PDLIM4被鉴定为核心调控因子,与干样特性和不良临床结局呈强相关性。功能验证证实,敲低PDLIM4可抑制ITH和肿瘤进展。本研究不仅建立了基于转录组的GBM异质性量化框架,还揭示了PDLIM4作为有前景的治疗靶点,为精准医学提供了新策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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