胶质母细胞瘤微环境中新型己糖激酶2相关炎症过程

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE325873

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细胞代谢失调是癌症的一个标志性特征，其中肿瘤细胞上调糖酵解途径，并通过“瓦伯格效应”优先将葡萄糖发酵为乳酸（而非丙酮酸）。己糖激酶2（HK2）催化糖酵解的第一个限速步骤，其肿瘤特异性上调已被确认为这种瓦伯格代谢的关键。探究抑制HK2表达对胶质母细胞瘤转录组的影响，有可能揭示若干新的经典/非经典关系，这些关系可作为未来的联合治疗靶点。为研究此问题，我们采用RNAseq技术比较了转染HK2靶向siRNA或非靶向阴性对照siRNA的胶质母细胞瘤细胞培养物的表达谱，从而鉴定出在HK2敲低后特异性差异表达的基因。

基因本体类别富集分析（GOSeq、富集图）以及对HK2敲低后（HK2KD）差异表达基因的STRING蛋白-蛋白相互作用分析，突显了HK2在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中调控炎症、免疫及血管生成相关过程方面潜在的非经典作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。