跨物种转录组整合揭示胶质瘤中MIRO1介导的巨噬细胞至T细胞信号轴驱动免疫抑制 [RNA-Seq]

该数据集为人类胶质瘤手术切除标本经离体MIRO1结合化合物MR3或溶剂对照处理后的bulk RNA-seq数据,包含1个文件GSE322979_series_matrix.txt.gz

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GSE322979: Cross-Species Transcriptomic Integration Reveals a Conserved, MIRO1-Mediated Macrophage-to-T Cell Signaling Axis Driving Immunosuppression in Glioma [RNA-Seq]

基本信息

模态
时间序列
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

跨物种转录组整合揭示胶质瘤中MIRO1介导的巨噬细胞至T细胞信号轴驱动免疫抑制 [RNA-Seq]

Cross-Species Transcriptomic Integration Reveals a Conserved, MIRO1-Mediated Macrophage-to-T Cell Signaling Axis Driving Immunosuppression in Glioma [RNA-Seq]

该数据集为人类胶质瘤手术切除标本经离体MIRO1结合化合物MR3或溶剂对照处理后的bulk RNA-seq数据,包含1个文件GSE322979_series_matrix.txt.gz。数据反映肿瘤组织整体转录程序,涵盖恶性细胞及间质与免疫成分的贡献,可用于分析人胶质瘤中MIRO1依赖的转录调控,并与小鼠单核RNA-seq数据进行跨物种整合,支持线粒体相关转录程序及其对免疫微环境影响的研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 04 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们生成了来自人类胶质瘤手术切除标本的bulk RNA测序(RNA-seq)数据,这些标本在离体条件下用MIRO1结合化合物(MR3)或溶剂对照处理。新鲜肿瘤标本在RNA提取和高通量转录组分析前,在受控条件下进行处理和培养,以表征肿瘤微环境(TME)中与治疗相关的基因表达变化。该数据集捕获了肿瘤组织的全局转录程序,反映了切除标本中恶性细胞以及间质和免疫成分的贡献。这些数据使得分析人胶质瘤中MIRO1依赖的转录调控成为可能,并促进与小鼠单核RNA-seq数据集的跨物种整合。该资源支持研究线粒体相关转录程序及其对免疫微环境的影响。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE322979

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 11 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们从经MIRO1结合化合物(MR3)或载体对照离体处理的人脑胶质瘤手术切除标本中生成了批量RNA测序(RNA-seq)数据。新鲜肿瘤标本在RNA提取和高通量转录组分析前,于受控条件下进行处理和培养,以表征肿瘤微环境(TME)内与治疗相关的基因表达变化。该数据集捕获了肿瘤组织的全局转录程序,反映了切除标本中恶性细胞以及基质和免疫成分的贡献。这些数据使得能够分析人脑胶质瘤中MIRO1依赖的转录调控,并促进与小鼠单核RNA-seq数据集的跨物种整合。该资源支持研究线粒体相关的转录程序及其对人脑胶质瘤免疫微环境重塑的影响。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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