MCUB缺陷人胶质母细胞瘤细胞转录组图谱

该数据集来自 NCBI GEO,收录了 MCUB 缺陷的人胶质母细胞瘤(GBM)细胞与相应对照细胞的基因表达谱比较结果。数据可用于识别 MCUB 缺失后基因表达变化及相关生物学通路,适用于肿瘤转录组差异表达分析与通路层面的分类研究(来源 NCBI)

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL211859606
GSE317497: Transcriptomic Profiling of MCUB-Deficient Human Glioblastoma Cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

MCUB缺陷人胶质母细胞瘤细胞转录组图谱

Transcriptomic Profiling of MCUB-Deficient Human Glioblastoma Cells

该数据集来自 NCBI GEO,收录了 MCUB 缺陷的人胶质母细胞瘤(GBM)细胞与相应对照细胞的基因表达谱比较结果。研究通过慢病毒载体构建稳定的 MCUB 缺陷细胞,并以 scramble 转导细胞作为对照,使用 Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression Microarray 8x60K 完成表达谱检测。数据可用于识别 MCUB 缺失后基因表达变化及相关生物学通路,适用于肿瘤转录组差异表达分析与通路层面的分类研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 25 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):为考察 MCUB 缺失对人胶质母细胞瘤(GBM)细胞的转录影响,我们比较了 MCUB 缺陷细胞与相应对照细胞的基因表达谱。细胞经慢病毒构建转导以建立稳定的 MCUB 缺陷,scramble 转导细胞用作对照。基因表达谱检测使用 Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression Microarray 8x60K 完成。所得数据用于识别 MCUB 缺失后的基因表达变化及相关生物学通路。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL21185、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE317497

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 02 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为研究MCUB缺失在人胶质母细胞瘤(GBM)细胞中的转录效应,我们比较了MCUB缺陷细胞与相应对照细胞的基因表达谱。通过慢病毒载体转导细胞以建立稳定的MCUB缺陷,并将转导 scramble 序列的细胞作为对照。使用Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression Microarray 8x60K进行基因表达谱分析。所得数据用于识别MCUB缺失后基因表达的变化及相关的生物途径。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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