胶质瘤诱导小胶质细胞DNMT3A减少促进抗肿瘤表型

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE314250

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数据说明

胶质母细胞瘤，IDH1野生型，是一种侵袭性原发性脑肿瘤，预后极差，会促进小胶质细胞（脑内固有的先天免疫细胞）的募集，并最终使其活化为肿瘤支持性表型，从而增强胶质瘤的增殖和侵袭能力。在此，我们报道，在胶质瘤细胞刺激下，小胶质细胞会经过一种具有抗肿瘤特性的反应性状态，该状态伴随着DNA甲基转移酶3A（DNMT3A）染色质占据减少和DNA去甲基化，从而促进与转化生长因子β（TGF-b）依赖性小胶质细胞稳态及小胶质细胞感知组相关的基因集表达。我们发现，在小胶质细胞中抑制Dnmt3a表达后，这些细胞在体外和体内均维持抗肿瘤属性。在一种同基因免疫活性胶质母细胞瘤小鼠模型中，脑内递送靶向Dnmt3a表达的反义寡核苷酸可导致小胶质细胞活化并减少肿瘤生长。

综上所述，我们的研究结果揭示了DNA去甲基化在调控胶质瘤细胞诱导的小胶质细胞激活中的参与，并表明小胶质细胞中的DNMT3A是治疗包括小胶质细胞成分在内的脑肿瘤如胶质母细胞瘤的潜在治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。