日本髓母细胞瘤队列的分子与临床特征:基于经济可及诊断方法的亚组特异性预后分层

该数据集来自日本小儿分子神经肿瘤学组(JPMNG)39家机构收集的242例髓母细胞瘤病例,旨在弥补亚洲人群大规模分子亚组数据的不足

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基因组分类GPL135349606
GSE313522: Molecular and clinical features of a Japanese medulloblastoma cohort: Subgroup-specific prognostic stratification using economical/accessible diagnostic methods

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

日本髓母细胞瘤队列的分子与临床特征:基于经济可及诊断方法的亚组特异性预后分层

Molecular and clinical features of a Japanese medulloblastoma cohort: Subgroup-specific prognostic stratification using economical/accessible diagnostic methods

该数据集来自日本小儿分子神经肿瘤学组(JPMNG)39家机构收集的242例髓母细胞瘤病例,旨在弥补亚洲人群大规模分子亚组数据的不足。数据通过NanoString基因表达谱、DNA甲基化芯片和MLPA拷贝数分析进行集中分子分型,并辅以靶向测序,包含1个文件(GSE313522_series_matrix.txt.gz)。可用于髓母细胞瘤的分子亚组分类、预后分层研究,以及评估经济可及诊断方法在临床中的应用价值(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 12 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):髓母细胞瘤是一种生物学和临床上异质性较强的儿童脑肿瘤。然而,大规模分子亚组研究主要在西方人群中进行,来自亚洲的综合数据仍然有限。为弥补这一空白,我们通过日本小儿分子神经肿瘤学组(JPMNG)从39家机构收集了242例髓母细胞瘤病例并进行分析。使用基于NanoString的基因表达谱、DNA甲基化芯片和多重连接依赖探针扩增(MLPA)进行拷贝数谱分析,并辅以靶向测序,完成了集中分子分型。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL13534、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE313522

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 29 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

髓母细胞瘤是一种在生物学和临床上具有异质性的儿童脑肿瘤。然而,大规模分子亚群研究主要在西方人群中进行,来自亚洲的综合数据仍然有限。为填补这一空白,我们通过日本儿童分子神经肿瘤学组(JPMNG)从39家机构收集了242例髓母细胞瘤病例进行分析。采用基于NanoString的基因表达谱分析、DNA甲基化芯片和多重连接依赖探针扩增(MLPA)进行拷贝数分析,并辅以靶向测序,完成了集中化的分子分型。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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