HDACi belinostat 在 YAP 和 TAZ 过表达的 IDH 突变胶质瘤培养物中介导的转录变化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308636

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDH1/2突变（IDHmut）会增加胶质瘤中DNA和组蛋白的甲基化。IDHmut抑制剂对低级别IDHmut胶质瘤有效，但针对高级别IDHmut胶质瘤的新策略仍有待开发。尽管组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACi）对IDH野生型（IDHwt）胶质母细胞瘤（GBM）无效，但其在IDHmut胶质瘤中的潜力尚未得到广泛研究。我们此前已证实，IDHmut胶质瘤对HDACi的敏感性高于IDHwt GBM。本研究表明，IDHmut仅与胶质瘤中对HDACi的更高敏感性相关，而在IDHmut软骨肉瘤或胆管癌中并非如此。HDACi耐药的两个介导因子YAP和TAZ在IDHmut胶质瘤中发生甲基化并被抑制，但在其他IDHmut癌症中并未如此。在IDHmut胶质瘤中诱导YAP或TAZ表达可赋予对HDACi的耐药性。在此，我们报告了HDACi贝利司他（belinostat）在表达或不表达YAP或TAZ的IDHmut胶质瘤中所介导的转录变化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。