GBM治疗INO-5104后基因表达分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307659

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数据说明

胶质母细胞瘤（GBM）患者未能从免疫检查点治疗中获益，很大程度上是由于肿瘤微环境中缺乏免疫活化的效应细胞，这凸显了亟需新策略以改善患者预后。靶向DNA免疫治疗与检查点阻断的联合方案有望克服这一障碍，通过刺激针对肿瘤抗原的靶向免疫反应并驱动T细胞浸润至胶质母细胞瘤GBM肿瘤微环境。我们将一种新型基于DNA的免疫治疗策略与cemiplimab（一种PD-1抑制剂）整合，联合大分割放疗（RT）加替莫唑胺化疗（TMZ）作为基础方案，开展了一项开放标签、单臂、两队列的1/2期临床研究，纳入52例符合条件的新诊断胶质母细胞瘤GBM患者，按肿瘤甲基鸟嘌呤甲基转移酶启动子甲基化状态分层：未甲基化（队列A）和甲基化（队列B）。

DNA免疫疗法INO-5401由三种质粒组成，分别靶向肿瘤相关抗原hTERT、WT-1和PSMA，另有一种编码IL-12的附加质粒INO-9012，通过肌内注射后电穿孔给药。主要终点为安全性；次要终点包括18个月总生存期（OS18）以及抗原特异性细胞和体液免疫应答。该研究方案耐受性良好。98%的患者经历了至少1次治疗中出现的不良事件（TEAE），多数与放疗或TMZ相关，且大多主要为1级或2级。队列A的18个月总生存期（OS18）和中位总生存期分别为50%和17.9个月，队列B分别为70%和32.9个月。值得注意的是，对INO-5401抗原表现出外周免疫应答的患者在18个月时生存机会更大。事后肿瘤分析显示免疫细胞活化和浸润增加。INO-5401 + INO-9012联合PD-1阻断和大分割放化疗诱导了t

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。