胶质母细胞瘤中少突胶质祖细胞样细胞分化与静息候选通路数据集

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE30626,聚焦胶质母细胞瘤中少突胶质祖细胞样细胞(OPC-like cells)分化与静息的候选通路

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL974610090
GSE30626: Candidate pathways for promoting differentiation and quiescence of oligodendrocyte progenitor-like cells in glioblastoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

胶质母细胞瘤中少突胶质祖细胞样细胞分化与静息候选通路数据集

Candidate pathways for promoting differentiation and quiescence of oligodendrocyte progenitor-like cells in glioblastoma

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE30626,聚焦胶质母细胞瘤中少突胶质祖细胞样细胞(OPC-like cells)分化与静息的候选通路。研究利用 bacTRAP 方法在正常小鼠脑中对主要细胞类型(包括 OPC)进行翻译谱分析,并进一步分析 Pdgf 驱动胶质瘤模型中的 Olig2+ 少突胶质细胞。结果确认 Olig2+ 肿瘤细胞与 OPC 最为相似,同时发现关键祖细胞基因的差异,这些差异基因可作为促进分化或静息的候选通路。数据包含 1 个文件,可用于表达谱分析与肿瘤细胞状态研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 13 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):成熟的中枢神经系统包含 PDGFRA+ 的“少突胶质祖细胞”(OPC),它们可能保持静息、增殖或分化为少突胶质细胞。在人类胶质瘤中,常可观察到类似 OPC 的快速增殖的 Olig2+ 细胞。我们试图在体内鉴定 OPC 分化或静息所特有的候选通路。利用 bacTRAP 方法,我们生成并分析了小鼠品系,用于在正常小鼠脑中对主要细胞类型(包括 OPC)进行翻译谱分析。随后,我们对 Pdgf 驱动胶质瘤小鼠模型中的少突胶质(Olig2+)细胞进行了分析。该分析证实 Olig2+ 肿瘤细胞与 OPC 最为相似,但同时也发现了关键祖细胞基因的差异——这些是促进分化或静息的候选基因。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL9746、10090。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE30626

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 12 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

成熟的中枢神经系统包含PDGFRA+的“少突胶质前体细胞”(OPC),这些细胞可能保持静息状态、增殖或分化为少突胶质细胞。在人类胶质瘤中,常观察到类似OPC的快速增殖的Olig2+细胞。我们旨在体内识别OPC分化或静息状态独特需要的候选途径。利用bacTRAP方法,我们生成并分析了小鼠品系,用于正常小鼠大脑中主要细胞类型(包括OPC)的翻译谱分析。随后,我们对来自Pdgf驱动胶质瘤小鼠模型的少突胶质(Olig2+)细胞进行了谱分析。该分析证实,Olig2+肿瘤细胞与OPC最为相似,但同时揭示了关键前体基因的差异——这些基因可能是促进分化或静息状态的候选因子。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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