可逆电穿孔后患者来源胶质母细胞瘤细胞的体外侵袭特性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305017

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景。基于电穿孔的疗法正被探索用于胶质母细胞瘤（GB）的治疗，作为增强药物递送或实现非热消融的手段。然而，关于亚致死性暴露如何影响GB肿瘤细胞的侵袭行为，目前知之甚少。材料与方法。首先对五株患者来源的GB细胞系进行内在侵袭潜能的初步筛选，并选取两株侵袭性最强的细胞系（NIB140 CORE和NIB216 CORE）用于进一步的電穿孔处理实验。将悬浮细胞暴露于高频双相电脉冲爆发，产生1 kV/cm的电场强度，对应于可逆电穿孔的条件。分别在电穿孔后24小时，通过Transwell实验和RNA转录组分析评估细胞侵袭和基因调控的变化。结果。1.0 kV/cm的可逆电穿孔以细胞系依赖的方式增强侵袭。NIB140 CORE显示出持续且显著的增加，侵袭细胞数量的中位数为假对照的3.74倍（274%）。相比之下，NIB216 CORE的侵袭仅表现出适度增加（1.30倍；30%）。

转录组分析显示，NIB140 CORE中与细胞外基质组织或离子通道活性相关的基因受到调控，NIB216 CORE中细胞骨架重塑相关基因受到调控，表明侵袭相关通路被激活。结论：这些发现凸显了GB细胞中促侵袭反应的潜在风险。在不可逆电穿孔肿瘤消融中，这一担忧涉及可能仅暴露于亚致死电场的周边区域细胞；而在电化学治疗中，若因局部药物递送不足导致透化细胞未被有效清除，也可能出现类似风险。尽管如此，两种受试细胞系的反应存在差异，凸显了患者特异性异质性以及在更多生理……（原文此处中断）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。