GBM脑膜免疫景观单细胞RNA测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE304648

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑膜在中枢神经系统的免疫监视中发挥关键作用，但硬脑膜对胶质母细胞瘤（GBM）免疫应答的贡献仍不明确。我们采用单细胞测序和T细胞受体追踪技术，分析了一组独特的GBM临床样本和小鼠临床前模型，并结合遗传扰动、光激活小鼠、体内mRNA递送和工程化人CAR T细胞，鉴定出硬脑膜中依赖MHC II类分子的免疫细胞枢纽，其可促进针对GBM的T细胞应答。经硬脑膜致敏的CD8+ T细胞迁移至肿瘤微环境（TME），并表现出增强的抗GBM效应功能。在机制研究中，我们证实经硬脑膜致敏的CD8+ T细胞这种增强的效应表型由PLAC8表达驱动，PLAC8通过MDM2稳定磷酸化STAT5。此外，我们鉴定出硬脑膜IL-33是CD8+ T细胞中PLAC8表达的诱导因子。基于脂质纳米颗粒的局部体内递送编码工程化IL-33的mRNA，可改善CD8+ T细胞的效应功能并延长荷胶质瘤小鼠的生存期。

总之，我们确定了硬脑膜是诱导GBM反应性T细胞的部位，通过一种新的IL-33-PLAC8-MDM2-pSTAT5轴，这些T细胞的效应功能得到改善。这些发现定义了硬脑膜在控制GBM的T细胞反应中的新作用，并确定了治疗干预的新靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。