NCDN缺失与对照U251胶质母细胞瘤细胞转录组

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299993

标准获取流程：

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数据说明

前体mRNA剪接由剪接体 orchestrate；剪接体是一个动态且高度调控的核糖核蛋白复合物，由五个小核核糖核蛋白颗粒（snRNPs）组成。尽管已有大量研究，snRNPs 的生物发生仍不完全清楚。在此，我们确定 neurochondrin（NCDN）是细胞质中前U5 snRNP生物发生的关键调控因子。NCDN直接结合AAR2，并促进其从PRPF8−AAR2−EFTUD2组装中间体中释放，这是U5 snRNP成熟所需的关键步骤。NCDN缺失会导致该中间体积累，从而导致成熟U5 snRNP水平降低。剪接体失调常导致与癌症相关的可变剪接异常。事实上，NCDN缺乏会抑制肿瘤细胞增殖并诱导凋亡，而NCDN高表达会促进肿瘤细胞生长，并与胶质母细胞瘤患者较差生存相关。转录组分析显示，NCDN缺失会导致广泛的可变剪接缺陷和基因表达变化。肿瘤相关基因的异常剪接可能促进胶质母细胞瘤的肿瘤进展。

总体而言，这些结果确立了NCDN作为U5 snRNP组装和剪接体功能的关键伴侣因子，并突显了NCDN作为治疗NCDN表达升高的胶质瘤的潜在治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。