AATF通过NRF-1依赖机制维持线粒体呼吸以支持胶质母细胞瘤细胞增殖 [ChIP-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299967

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数据说明

癌细胞优先利用糖酵解作为主要能源以促进细胞增殖的能力，长期以来一直被视为肿瘤代谢的一个标志性特征。然而，新出现的证据表明情况更为复杂，许多肿瘤在其发生和维持过程中表现出对线粒体氧化磷酸化（OXPHOS）呼吸的显著依赖。与此一致，大量研究报道了多种癌症类型中线粒体基因和OXPHOS组分的上调。胶质母细胞瘤（GBM）是成人中最常见且最具恶性的脑肿瘤，以快速增殖、治疗抵抗和复发能力为特征。除了深刻的遗传和分子异质性外，GBM还表现出强烈的代谢异质性，对线粒体活性的依赖程度各不相同。值得注意的是，转录因子核呼吸因子1（NRF-1）作为OXPHOS基因表达和线粒体功能的关键调控因子，近期已被证实与GBM的进展和不良预后相关。

Che-1/凋亡拮抗转录因子（AATF）是一种转录调节因子，在多种癌症类型中发挥关键作用，通过促进细胞周期阻滞和凋亡以及治疗耐药性来促进肿瘤发生。在此，我们表明AATF表达与GBM患者的临床结局相关。此外，我们证明其耗竭导致GBM细胞细胞周期阻滞、线粒体呼吸受损和线粒体结构破坏。特别是，我们提供证据表明AATF与NRF-1相互作用，并且通过影响RNA聚合酶II募集和染色质结构，对NRF-1介导的OXPHOS基因转录至关重要。总体而言，我们的发现突出了AATF在GBM增殖和线粒体代谢中先前未被认识的作用，并提示其作为治疗干预的潜在靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。