胶质母细胞瘤侵袭解码:肿瘤组装体中环境与细胞周期效应的单细胞图谱
研究由 Akhunbay-Fudge 等人完成,开发两种单细胞分析技术解析胶质母细胞瘤侵袭表型,比较肿瘤侵入神经与内胚层谱系组装体的差异,并建立 DyPheT 追踪算法实时关联细胞周期与恶性细胞迁移

基本信息
资源简介
胶质母细胞瘤侵袭解码:肿瘤组装体中环境与细胞周期效应的单细胞图谱
Decoding glioblastoma invasion: single-cell profiling of environmental and cell cycle effects in tumour assembloids
该数据集来自 NCBI GEO(GSE298718),包含 1 个文件(GSE298718_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序表达谱技术,物种为人类(9606),平台为 GPL24676。研究由 Akhunbay-Fudge 等人完成,开发两种单细胞分析技术解析胶质母细胞瘤侵袭表型,比较肿瘤侵入神经与内胚层谱系组装体的差异,并建立 DyPheT 追踪算法实时关联细胞周期与恶性细胞迁移。数据可用于研究肿瘤微环境变化、侵袭相关基因表达及“go-and-grow”侵袭范式(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 02 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Akhunbay-Fudge 等人开发了两种单细胞分析技术,用于解析胶质母细胞瘤的侵袭表型,重点关注肿瘤组装体内谱系定向(神经与内胚层)和细胞周期进程的影响。该研究采用单细胞 mRNA 测序,比较肿瘤侵入神经与内胚层谱系组装体的情况,并建立“DyPheT”追踪算法,实时关联脑类器官中细胞周期时相与恶性细胞迁移。这些互补方法揭示了胶质母细胞瘤诱导的环境细胞变化,识别了肿瘤细胞中组装体侵袭的细胞自主基因表达谱,并强调了一种“go-and-grow”侵袭范式,鉴定出在 S/G2 期活跃的高迁移性细胞。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298718
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 07 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
Akhunbay-Fudge等人开发了两种单细胞分析技术,以解析胶质母细胞瘤侵袭表型,重点关注肿瘤组装体中谱系定向(神经与内胚层)及细胞周期进程的影响。该研究采用单细胞mRNA测序技术,对比肿瘤侵袭神经与内胚层谱系组装体的情况,并建立了“DyPheT”追踪算法,实时关联细胞周期阶段与脑类器官中恶性细胞的迁移。这些互补方法揭示了胶质母细胞瘤诱导的环境细胞变化,确定了肿瘤细胞中组装体侵袭的细胞自主基因表达谱,并强调了“先迁移后增殖”的侵袭模式,识别出在S/G2期高度活跃的迁移细胞。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




