胶质母细胞瘤主调控miRNA的发现与治疗开发

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数据说明

胶质母细胞瘤是一种致命的原发性恶性脑肿瘤。尽管采用了手术切除、化疗和放射治疗等疗法，胶质母细胞瘤患者的平均生存期仍约为15个月。微小RNA（miRNA）是一类短的非编码RNA分子，可调控大多数人类基因的表达。在胶质母细胞瘤中，众多基因同时发生失调。因此，分子单药治疗未能改善临床结局。多项证据表明，需要同时靶向多个失调分子才能实现更好的治疗。然而，同时靶向多个失调的致癌驱动因素受到严重限制，原因在于目前尚不存在靶向许多失调分子所需的药物，并且在临床环境中联合使用多种药物会导致毒性呈指数级增加。我们假设，我们可以开发并使用miRNA来同时抑制多个失调基因，从而实现更有效的胶质母细胞瘤治疗。

因此，本研究的目的是鉴定主调控microRNA（miRNA），并利用它们同时靶向多个失调分子以治疗GBM。我们将主调控miRNA定义为那些在胶质母细胞瘤中靶向多个失调基因的miRNA。为了寻找主调控miRNA，我们首先利用PAR-CLIP筛选来鉴定胶质母细胞瘤细胞中所有miRNA的全部靶标。随后，我们分析TCGA肿瘤数据，以确定这些靶标中哪些在人类肿瘤中发生失调。我们开发并使用了一种算法，根据失调程度、失调频率以及与患者生存的相关性，对这些靶标在胶质母细胞瘤恶性程度中的重要性进行排序。接着，我们根据miRNA靶向多个胶质母细胞瘤失调基因的能力，以及因此作为治疗手段递送时表现出强抗肿瘤效应的潜力，对这些miRNA进行了排序。利用这一策略，我们

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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