快速进展型HAM/TSP患者脑脊液影响人胶质母细胞瘤细胞系线粒体DNA转录与结构

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE290808

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

人类T淋巴细胞病毒1型（HTLV-1）相关脊髓病/热带痉挛性截瘫（HAM/TSP）是一种影响运动和感觉功能的进行性神经退行性疾病。虽然脑脊液（CSF）的改变已被用于识别该疾病的生物标志物，但HTLV-1脑脊液对神经细胞的影响仍未被探索。在此，我们研究了HTLV-1感染患者的脑脊液对胶质母细胞瘤细胞系的影响。脑脊液样本取自HTLV-1无症状携带者（HAC）（n=13）和HAM/TSP患者（n=21），后者根据疾病进展速度分为：极慢速（HAMvs）、典型（HAMt）和快速（HAMr）。用HTLV-1脑脊液处理的胶质母细胞瘤细胞的RNA测序显示，基因表达发生了显著变化，尤其是HAMr脑脊液，其导致线粒体DNA转录本显著下调。共聚焦显微镜显示线粒体网络的表型变化：与其他患者组的脑脊液相比，暴露于HAMr脑脊液的星形胶质细胞表现出更简单的线粒体网络。其特征是线粒体分支减少、每分支长度的连接点减少以及分支直径略有增加。

与未处理的细胞相比，HTLV+脑脊液扰乱了线粒体代谢。然而，这些变化在代谢层面有限，并且似乎不随HTLV供体状态而显著变化。总之，我们的发现表明，HTLV+脑脊液诱导胶质母细胞瘤细胞中的线粒体重组，可能有助于补偿脑脊液暴露所引起的应激。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。