LOXL3敲除导致U87MG和U251细胞微管动力学失调引发有丝分裂灾难与衰老
该数据集来自NCBI GEO,包含GSE288138系列数据,聚焦于胶质母细胞瘤(GBM)细胞系U87MG和U251中LOXL3基因敲除后的转录组表达谱

基本信息
资源简介
LOXL3敲除导致U87MG和U251细胞微管动力学失调引发有丝分裂灾难与衰老
Dysregulation of microtubule dynamics caused by LOXL3 knockout triggers mitosis catastrophe and senescence in U87MG and U251 cells
该数据集来自NCBI GEO,包含GSE288138系列数据,聚焦于胶质母细胞瘤(GBM)细胞系U87MG和U251中LOXL3基因敲除后的转录组表达谱。研究通过CRISPR-Cas9技术实现高效沉默,发现敲除导致细胞活力下降,转录组富集分析显示U87MG细胞中微管蛋白乙酰化相关基因下调,并经Western blot验证;两种细胞均出现细胞周期和增殖相关基因下调。数据可用于分析LOXL3在GBM微管动力学调控中的作用,以及有丝分裂灾难和衰老相关的基因表达变化(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jan 27 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):胺氧化酶LOXL3已被认为与肿瘤发生和进展有关,在胶质母细胞瘤(GBM)中表达升高。该酶影响GBM细胞的黏附、迁移和增殖,并已被证明与微管蛋白表达相关。微管作为细胞骨架的主要成分,对细胞周期和有丝分裂进程至关重要。在本研究中,使用CRISPR-Cas9在两种GBM细胞系U87MG和U251中进行LOXL3敲除,以实现高沉默效率。敲低导致两种细胞系的细胞活力下降。U87MG细胞的转录组富集分析显示,与微管蛋白乙酰化相关的基因下调,随后通过Western blot分析证实。U87MG和U251细胞均表现出细胞周期和增殖相关基因的下调。功能实验证实,LOXL3敲除
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL21697、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE288138
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 04 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
胺氧化酶LOXL3已被证实与肿瘤的发生和进展相关,在胶质母细胞瘤(GBM)中表达升高。该酶影响GBM细胞的黏附、迁移和增殖,并已被证明与微管蛋白表达相关。微管作为细胞骨架的主要成分,对细胞周期和有丝分裂进程至关重要。本研究采用CRISPR-Cas9技术在U87MG和U251两种GBM细胞系中进行LOXL3敲除,以实现高沉默效率。敲低导致两种细胞系的细胞活力均下降。对U87MG细胞的转录组富集分析显示,与微管蛋白乙酰化相关的基因表达下调,随后通过Western blot分析得到证实。U87MG和U251细胞均表现出细胞周期和增殖相关基因的下调。功能实验证实,LOXL3敲除细胞表现出细胞周期进程延迟,以及在中期-后期转换过程中有丝分裂纺锤体的显著改变。核分析显示,U87MG细胞出现提示有丝分裂灾难的形态学改变,而U251细胞则出现衰老。
此外,LOXL3敲除克隆显示出细胞黏附和迁移能力降低。有趣的是,在GBM细胞系中敲低LOXL3会减少微管蛋白乙酰化,以TP53突变依赖的方式导致有丝分裂灾难及随后的细胞死亡。这些发现凸显了将靶向LOXL3作为联合策略的潜力,可推动TP53突变型GBM的研究进展并开发新的治疗方法。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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