辐射诱导细胞可塑性使胶质母细胞瘤对Forskolin介导的分化敏感 [bulk RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285545

标准获取流程：

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数据说明

胶质母细胞瘤是成人中最致命的脑癌，所有患者最终都死于该肿瘤。尽管手术联合放化疗可延缓疾病进展，但这些治疗无法实现肿瘤控制，靶向治疗或生物制剂也未能进一步改善生存。利用辐射诱导的短暂多能性状态，我们使用腺苷酸环化酶激活剂佛司可林来改变受照射胶质瘤细胞的命运。研究了联合治疗对神经元标志物表达、细胞周期分布和增殖的影响。使用bulk RNA-seq进行基因表达谱分析。使用单细胞RNA-seq研究细胞群体的变化。在极端有限稀释实验中研究了对胶质瘤干细胞的影响，并在胶质母细胞瘤的同系和PDOX小鼠模型中研究了对其中位生存期的影响。联合治疗诱导胶质瘤细胞中神经元标志物的表达，减少增殖，并导致独特的基因表达谱。scRNA-seq揭示，联合治疗迫使胶质瘤细胞进入小胶质细胞样和神经元样表型。

在体内，该治疗导致胶质瘤干细胞丢失并延长了中位生存期。总体而言，我们的数据表明，重新审视使用佛司可林联合放射治疗的分化疗法可能带来临床益处。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。