GSE285513:胎儿癌基因 NUAK2 是胶质母细胞瘤的新兴靶点

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE285513,聚焦胎儿癌基因 NUAK2 在胶质母细胞瘤中的作用。源站描述指出 NUAK2 在小鼠和人脑胚胎期高表达、出生后下降并在恶性胶质瘤中重新表达,且 CRISPR-Cas9 介导的 NUAK2 缺失可抑制 GBM 细胞增殖与迁移

geo
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基因组分类GPL246769606
GSE285513: A fetal oncogene NUAK2 is an emerging target in glioblastoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

GSE285513:胎儿癌基因 NUAK2 是胶质母细胞瘤的新兴靶点

A fetal oncogene NUAK2 is an emerging target in glioblastoma

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE285513,聚焦胎儿癌基因 NUAK2 在胶质母细胞瘤中的作用。源站描述指出 NUAK2 在小鼠和人脑胚胎期高表达、出生后下降并在恶性胶质瘤中重新表达,且 CRISPR-Cas9 介导的 NUAK2 缺失可抑制 GBM 细胞增殖与迁移。数据集包含 1 个文件 GSE285513_series_matrix.txt.gz,主题为高通量测序表达谱分析,物种为 9606(人),可用于研究 NUAK2 在胶质母细胞瘤发生中的表达特征及相关机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 29 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):多形性胶质母细胞瘤(GBM)是成人脑癌中最常见且高度恶性的形式,以总体生存率差为特征。有效的治疗手段仍然有限,因此需要新的治疗方法。神经发育通路已被牵涉到胶质瘤形成中,关键的神经发育调控因子在胶质瘤肿瘤发生过程中被重新表达或被劫持利用。在这里,我们在小鼠和人脑中鉴定出一种丝氨酸/苏氨酸激酶,NUAK 家族激酶 2(NUAK2),作为一种胎儿癌基因。我们发现 NUAK2 在胚胎脑中强表达,在整个出生后阶段下降,然后在恶性胶质瘤中重新表达。然而,NUAK2 在 GBM 肿瘤发生中的作用仍不清楚。在这里,我们证明 CRIPSR-Cas9 介导的 GBM 细胞中 NUAK2 缺失导致增殖和迁移受到抑制,而过表达导

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285513

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 17 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285513

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

多形性胶质母细胞瘤(GBM)是成人脑癌中最常见且恶性程度最高的类型,其总体生存率极低。有效的治疗手段仍然有限,因此迫切需要新型治疗方法。神经发育通路已被证实与胶质瘤的形成有关,关键的神经发育调控因子在胶质瘤肿瘤发生过程中被重新表达或被劫持利用。在本研究中,我们鉴定了一种丝氨酸/苏氨酸激酶——NUAK家族激酶2(NUAK2),在小鼠和人脑中作为胎儿癌基因发挥作用。我们发现NUAK2在胚胎脑中呈强表达,在整个出生后阶段逐渐降低,随后在恶性胶质瘤中重新表达。然而,NUAK2在GBM肿瘤发生中的作用仍不清楚。在此,我们证明CRISPR-Cas9介导的GBM细胞中NUAK2缺失导致增殖和迁移受到抑制,而过表达则在体外和体内模型中均导致增殖和迁移增强。进一步研究NUAK2缺失后失调的下游生物学过程发现,NUAK2通过调节细胞外基质(ECM)成分来促进迁移行为。

最后,我们确定药物抑制NUAK2足以阻碍恶性胶质瘤细胞的增殖和迁移。我们的结果表明,NUAK2是GBM治疗中一个可行的治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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