ATRT亚型分化轨迹中循环祖样细胞群snRNA多组学组织数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE283842

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

非典型畸胎样横纹肌样瘤（ATRTs）以SMARCB1缺失为特征，是最致命的儿童脑肿瘤之一。目前已鉴定出三种分子亚型，每种亚型具有独特的分子和临床特征。然而，尚无亚型特异性治疗方法，这凸显了理解其亚型间及亚型内异质性的必要性。在本研究中，我们构建了ATRT的单核转录组图谱，并通过单细胞ATAC-seq和空间转录组学进行了验证，以研究亚型特异性分化轨迹。我们在独特的亚型特异性分化谱系中鉴定出保留的脑祖细胞表达谱。在所有ATRT患者中均观察到一种共享的、呈增殖状态的祖细胞样细胞群体，散布于肿瘤各处。最后，我们证明可通过药物手段在ATRT肿瘤类器官中诱导亚型特异性分化轨迹，引导肿瘤细胞向非增殖性成熟表型转化。我们的研究揭示，ATRT亚型表现出与正常胎儿脑发育相镜像的信号轨迹，有望为开发针对ATRT的成熟化疗法提供可能。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。