低级别胶质瘤表达谱数据集 GSE28238

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低级别胶质瘤表达谱数据集 GSE28238

GSE28238 是一个以低级别胶质瘤（Low grade gliomas，LGG）为研究对象的基因表达谱数据集，源站标题即为“Low grade gliomas”。该数据集的核心特征在于按照病变部位对低级别胶质瘤进行分组，区分幕下（infratentorial）与幕上（supratentorial）两类，从而为基于基因表达谱的肿瘤部位相关分类研究提供数据基础。数据集由 Samantha Mascelli 提交，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，在本站归入肿瘤 / 脑肿瘤分类。数据集共包含 1 个文件，样例文件为 GSE28238_series_matrix.txt.gz，主题标签涉及表达谱芯片分析、GPL570 平台以及物种编号 9606。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

低级别胶质瘤是脑肿瘤研究中的重要类型，其发生部位与肿瘤的生物学行为、临床管理策略之间存在关联。源站描述指出，该数据集的目的在于对低级别胶质瘤按其病变部位进行归类，即区分幕下与幕上两类。这一分组方式使得数据集可用于考察不同部位肿瘤在基因表达层面的差异，为部位相关的分类研究提供素材。数据集在本站被归入肿瘤 / 脑肿瘤类别，主题标签中包含表达谱芯片分析，说明其数据形式为芯片表达谱。

【数据内容】

该数据集共包含 1 个文件，样例文件名为 GSE28238_series_matrix.txt.gz，采用 GZIP 压缩格式。从主题标签看，数据基于 GPL570 平台产生，物种编号为 9606，即人类。数据集以表达谱矩阵的形式组织，适合用于基因表达层面的比较分析。源站未提供样本数量、基因数量、分组样本分布等具体细节。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，作者为 Samantha Mascelli，发布时间为 Mar 29 201。源站描述仅说明该数据集用于按病变部位对低级别胶质瘤进行分组，即幕下与幕上两类。关于样本采集地点、采集时间、临床信息、伦理审批等具体内容，源站未提供。

【适用场景】

基于源站描述，该数据集适用于低级别胶质瘤中与肿瘤部位相关的基因表达谱分类研究，例如比较幕上与幕下病变在表达层面的差异，或用于构建部位相关的分类模型。主题标签中的表达谱芯片分析提示其可用于芯片表达数据的二次分析。由于数据集规模信息有限，具体可支持的统计比较类型需结合实际样本情况判断，源站未提供相关说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE28238_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因格式或编码问题导致分析错误。数据以表达谱矩阵形式提供，读取后可按病变部位分组进行后续分析。源站未提供具体的分析流程或推荐工具。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件，样本规模、分组均衡性、数据完整性等信息源站未提供。由于源站描述较为简略，仅说明按病变部位分组，缺少临床注释、批次信息与质控细节，使用时需自行评估数据适用性。发布时间为 Mar 29 201，年份信息不完整，源站未提供更精确的日期说明。

【引用与许可】

数据集的作者为 Samantha Mascelli，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用方式、许可条款与使用限制，源站未提供。